【摘 要】
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家禽的皮肤具有沉积色素的能力,色素沉积影响肤色,而肤色作为重要的经济性状影响着肉鸡的销售。由于影响皮肤颜色的因素复杂繁多,肉鸡的屠体颜色变化很大,某些个体的皮肤可能偏白色或淡黄色,影响鸡群肤色的均匀度,不利于冰鲜销售。本实验以麻黄鸡为实验对象,研究规模化养殖条件下肉鸡皮肤黄度的测量方法,分析肉鸡皮肤黄度的遗传规律,探索肉鸡皮肤黄度的选择方法,挖掘肉鸡皮肤色素沉着的分子机制。主要结果如下:1.鸡皮肤
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家禽的皮肤具有沉积色素的能力,色素沉积影响肤色,而肤色作为重要的经济性状影响着肉鸡的销售。由于影响皮肤颜色的因素复杂繁多,肉鸡的屠体颜色变化很大,某些个体的皮肤可能偏白色或淡黄色,影响鸡群肤色的均匀度,不利于冰鲜销售。本实验以麻黄鸡为实验对象,研究规模化养殖条件下肉鸡皮肤黄度的测量方法,分析肉鸡皮肤黄度的遗传规律,探索肉鸡皮肤黄度的选择方法,挖掘肉鸡皮肤色素沉着的分子机制。主要结果如下:1.鸡皮肤黄度的测量、遗传规律和选择方法为了对肉鸡皮肤黄度值变化进行分析,我们选取了600只麻黄鸡纯系为实验动物,结合色差仪获取的单个部位的黄度值数据和MATLAB获取的整体肤色数据进行关联分析。结果显示肉鸡屠宰前和屠宰后,局部和整体的肤色显著关联,其中屠宰前泄殖腔周围皮肤的肤色黄度值与屠宰后整体黄度值呈正相关;DMU的单性状动物模型分析显示,皮肤黄度值的遗传力偏低,和部分肉质性状遗传正相关;高效液相色谱分析发现血清类胡萝卜素浓度值和皮肤黄度值正相关。以上发现将有助于在不拔毛和宰杀肉鸡的条件下,对肉鸡的肤色进行评估和选育。2.BCO2基因的3个SNPs不影响麻黄鸡的黄度值BCO2是影响家鸡黄皮肤性状的重要基因,我们选取310只商品代麻黄鸡作为实验群体分析BCO2的3个经典SNP（chr24:6264085,chr24:6273428,chr24:6287900）和皮肤黄度的关联。结果表明,BCO2的3个经典SNPs在麻黄鸡中的基因型分别为:A位点chr24:6264085全部为AA基因型,C位点chr24:6287900全部为GG基因型,只有B位点chr24:6273428存在GG/GA/AA三种基因型,且在该位点附近发现了2个连锁的新SNPs。将基因型和肤色数据关联分析结果表明这3个SNPs与麻黄鸡的皮肤黄度都不相关（P＞0.05）;单倍型GGTTAA个体的前胸黄度值显著高于单倍型GACTGG（P＜0.05）,同时高于单倍型AATTGG和GACTGA。3.麻黄鸡肤色相关基因的初筛为了挖掘更多可能参与皮肤黄度形成的基因,我们根据黄度值选取了皮肤两尾样和腹脂两位样进行RNA-seq和q RT-PCR分析,找到了一些参与皮肤黄度形成的候选基因和调控通路。蛋白互作网络分析表明,类胡萝卜素、黑色素和免疫过程之间的相互影响影响鸡皮肤色素沉积。4.ALDH1A3基因的SNP和麻黄鸡肤色显著相关RNA-seq和q RT-PCR结果都表明,ALDH1A3基因在皮肤组织之间极显著差异表达。ALDH1A3是类胡萝卜素代谢产物维甲酸的合成酶之一,参与了细胞内类胡萝卜素的代谢。本实验通过扩增ALDH1A3的3’非编码区序列,寻找SNP,并和肤色关联分析检测ALDH1A3的SNP对麻黄鸡肤色的影响。结果显示,ALDH1A3基因3’非编码区序列存在4个SNP,分别为g.117 T＞C,g.170 A＞,g.196 A＞T,g.703 T＞C。这四个SNP与麻黄鸡的肤色显著关联,同时与体尺性状和屠体性状也存在相关。这些SNPs可以作为新的分子标记,通过确定鸡的这些SNP位点的基因型对鸡的肤色、体尺性状、屠体性状进行早期选择,节省生产成本并加快遗传进展,更好地应用于鸡的育种中,具有很大的经济应用价值和科研价值。综上,本研究数据表明鸡屠宰前和屠宰后,局部和整体的肤色数据显著关联,同时活体泄殖腔的肤色和屠宰后的肤色显著相关;皮肤黄度的遗传力偏低,和部分肉质性状遗传正相关;血清类胡萝卜素浓度和皮肤黄度相关;BCO2的3个经典SNPs不影响本实验群体麻黄鸡的皮肤黄度;通过RNA-seq分析,发现一些基因可能参与麻黄鸡的肤色形成;在ALDH1A3基因3’非编码区序列发现4个SNPs,与鸡的肤色性状相关,具有育种应用的潜力。以上研究结果不仅为麻黄鸡皮肤黄度的测量和黄皮肤性状的选择提供数据参考,而且为提高肉鸡养殖过程中肤色一致性措施的研究提供了参考。
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