长链非编码RNA AC005479.2对甲状腺乳头状癌细胞迁移和侵袭的影响

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目的:甲状腺癌(thyroidcancer)是一种非常常见的内分泌系统肿瘤,近年来,在全球范围内甲状腺癌的发病率增长迅速,其中,甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)的增长尤其迅速,在过去的三十年中,其发病率增加了 240%。在我国,甲状腺癌的发病率每年可能会增长20%。虽然甲状腺癌的预后较好,但是长期来看,仍然有很多甲状腺乳头状癌的患者在二十年后发生复发。因此,获得影响PTC预后的关键分子,提高患者的无病生存率仍然是非常有价值的。长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA),是长度大于200个核苷酸的不编码蛋白质的RNA。长链非编码RNA的概念大约在20多年前提出,对于长链非编码RNA与癌症的研究已经成为当今热点,最近许多的研究都揭示了长链非编码RNA在基因调节中的重要作用比如染色质修饰、转录激活干扰等。此外,也有研究发现长链非编码RNA在癌症中常常表达失调,并且可能促进肿瘤生长、迁移或侵袭并诱导细胞凋亡。本课题采用大数据分析策略筛选影响PTC预后的lncRNA,探讨其在PTC中的作用并验证其作用机制,为PTC恶性进展提供新的候选靶标。方法:1.通过TCGA数据库预测在甲状腺癌患者中高表达的lncRNA。2.预测可能有竞争内源性RNA的基因配对。3.对预测得到的lncRNA以及靶基因进一步生信分析。4.通过实时荧光定量PCR去检测长链非编码RNA AC005479.2在TPC-1细胞以及正常的甲状腺滤泡上皮细胞之间是否存在差异表达。5.通过转染慢病毒来下调TPC-1细胞中长链非编码RNA AC005479.2的表达,来检测其是否对TPC-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力产生影响。6.通过实时荧光定量PCR去检测下调了长链非编码RNAAC005479.2后,TPC-1细胞中的BCL2L1基因的表达是否会随之发生改变。7.通过双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA AC005479.2与mir-204-5p直接结合,mir-204-5p是否与BCL2L1直接结合。结果:1.通过TCGA数据库筛选出在甲状腺癌中高表达的lncRNA、miRNA和mRNA。2.根据差异表达量分析以及碱基配对的方法筛选出可能存在ceRNA关系的lncRNA AC005479.2及其下游基因。3.对lncRNA AC005479.2及其靶基因进行预后分析以及富集分析等,发现其对预后有影响,并且与miRNA对癌症的通路相关。4.在下调了长链非编码RNAAC005479.2后,TPC-1细胞的增殖活性没有受到明显的影响,而迁移和侵袭能力被抑制了。5.下调了长链非编码RNAAC005479.2后,TPC-1细胞中的BCL2L1基因的表达量也下调了。6.长链非编码RNAAC005479.2与mir-204-5p直接结合,而mir-204-5p与BCL2L1直接结合。结论:长链非编码RNA AC005479.2可能通过竞争性结合mir-204-5p从而调控BCL2L1基因来实现抑制甲状腺乳头状癌细胞迁移和侵袭的能力。
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