一株海洋细菌Gilvimarinus polysaccharolyticus YN3T多相分类学研究及六株盐环境来源微生物全基因组生物信息学分析

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhoulina1314
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种类繁多而又神秘的海洋微生物,大多数仍处在人类知识领域未知的范围之内,但其生物种类、特征、代谢通路以及环境适应机制在生态作用理论中有着重要价值。本论文围绕一株分离自沿海藻样本中的微生物新种,展开了多相分类学研究,并对其进行全基因组测序,深入探求其基因组特征与表型特征的对应关系,寻找其环境适应性的生存机制。采用微生物新种的多相分类学方法对分离自海藻样品的菌株YN3T进行新种鉴定和特征描述。根据其表型、化学分类和遗传特征上与标准菌株Gilvimarinus chienesis和’Gilvimarinus agarilyticus’的异同,在Gilvimarinus属下建立了一个新种Gilvimarinus polysaccharolyticus,丰富了该属的物种信息。同时,采用高通量测序手段获得该新种的全基因组序列,对其进行注释和分析,着重寻找其中与琼脂代谢有关的基因,并分析了菌株YN3T与藻类可能的共生关系和在工业上潜在的应用价值。本研究中,还对Halomonadaceae科三株亲缘关系相近的细菌Halomonas zincidurans B6T, Halomonas xinjiangensis TRM 0175T和Chromohalobacter israelensis DSM 6768 T进行了全基因组分析,并比较了其对于环境重金属抗性能力的区别。另外,对细菌Amphibacillus jilinensis Y1T和古菌Natrinema altunense AJ2T也进行了全基因组测序和比较分析。分别统计了他们的基因组特征和其中与环境适应或表型相关的特色基因或代谢通路,以期能够借助基因组信息,为研究微生物盐度耐受、重金属耐受和极端环境适应机制提供了理论指导。
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