基于定量蛋白质组学的类风湿性关节炎预后不良指标筛选及预测模型建立的研究

来源 :宁波大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anonyjim
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:筛选并验证类风湿性关节炎预后相关生物标志物,通过建立预后模型,为预测类风湿性关节炎结局、早期治疗及指导治疗方案提供新的思路和理论基础。方法:前期我们应用TMT标记定量蛋白组技术对21例初发RA患者和21例健康对照者的血清进行差异蛋白的检测,并根据生物信息学分析筛选出6个差异蛋白;使用ELISA法对36例RA患者及40例健康对照者的外周静脉血进行差异蛋白的验证。以上36例RA患者均采用以甲氨蝶呤为主的治疗方案,随访半年后,采集其外周静脉血,根据治疗后疾病活动度情况及是否合并关节外表现,分为预后改善组和预后不良组,通过ELISA法对治疗后的RA患者进行差异蛋白的定量检测,比较各蛋白在预后改善组及预后不良组之间的差异,从而筛选出预后相关生物标志物。通过收集42例初发RA患者的高分辨率CT,根据CT报告将42例RA患者分为无间质性肺病组和合并间质性肺病组,比较后筛选出与间质性肺病相关的差异蛋白。综合此次实验评估的各项指标,包括:年龄、ESR、CRP、DAS28、关节压痛数、RAP1B,采用Logistics回归分析类风湿性关节炎患者预后不良的危险因素,构建预后相关模型;衡量模型的校准度,使用ROC曲线分析模型的预测价值,并对模型进行验证。结果:1、使用TMT标记定量蛋白组技术寻找出RA患者、健康对照者之间的差异蛋白,根据KEGG通路分析、GO富集分析,PPI分析并结合文献检索结果,发现6个差异蛋白与RA密切相关,分别为:血清淀粉样蛋白A1(SAA1)、S100钙结合蛋白A8(S100A8)、S100钙结合蛋白A9(S100A9)、Ras相关蛋白Rap-1b(RAP1B)、α-辅肌动蛋白1(ACTN1)、热休克蛋白β1(HSPB1)。2、利用ELISA技术对筛选出的差异蛋白进行验证,发现在治疗前后RA患者组中SAA1、S100A8、S100A9、RAP1B、ACTN1和HSPB1蛋白的表达水平均高于健康对照组,且差异均具有统计学意义。3、在治疗前的预后改善组及预后不良组疾病活动度无明显差异的前提下,发现预后改善组的年龄、血沉、尿酸、白细胞计数、RAP1B及ACTN1蛋白的表达水平明显低于预后不良组,差异具有显著性。同时比较治疗后两组之间的临床数据及差异蛋白后,发现治疗后的预后不良组RA患者的年龄、DAS28、ESR、CRP、关节压痛数及RAP1B的表达水平明显高于预后改善组且具有统计学意义。4、通过ELISA技术对是否合并间质性肺病的两组RA患者进行差异蛋白的定量检测,比较后发现,合并间质性肺病的RA患者的疾病活动度及RAP1B的表达水平高于无间质性肺病组,差异具有显著性意义。5、多因素Logistics回归分析显示,ESR(OR=1.048,95%CI:1.006~1.091,P=0.024)、RAP1B(OR=1.037,95%CI:1.006~1.068,P=0.017)与RA预后不良相关,可作为判断RA预后不良的危险因素。通过综合分析上述预后相关的危险因素,得出预测类风湿性关节炎患者预后不良的模型:P=1/(1+e^(6.008-0.046×ESR-0.036×RAP1B)),且模型的拟合程度良好,ROC曲线下面积为0.861(95%CI:0.745~0.977)。结论:1、通过TMT定量蛋白技术筛选RA相关生物标记物,经过验证后发现,RAP1B蛋白被认为与类风湿性关节炎预后相关,可作为潜在的生物标志物对RA的预后情况进行指导。2、通过Logistics回归分析,建立RA预后不良的模型:P=1/(1+e^(6.008-0.046×ESR-0.036×RAP1B)),ROC曲线下面积为0.861,更加体现本研究构建的预测模型的高效性,临床应用价值高。
其他文献
结合对高中课堂传统教学模式中主要问题的分析,对"对分课堂"的教学改革新模式进行了初步探索。以难度较大的"孟德尔的豌豆杂交实验(二)"为例,尝试当堂对分教学,通过观察课堂学生的反应,根据课后练习题的检测结果,表明采取PDA模式极大地调动了学生的学习积极性,提高了课后习题的完成率。
期刊
<正>大力发展少数民族文化事业,是少数民族事业“十一五”规划的一项重要任务。根据国家区域发展总体战略,规划提出要继续在文化基础设
期刊
研究目的本课题小组前期工作已验证药物敏感性肺炎克雷伯菌(DSKP)经亚胺培南体外诱导后可对碳青霉烯类抗生素产生耐药,其耐药性不依赖于碳青霉烯酶,与膜孔蛋白omp K35表达下降有关。基于以上实验结果,本课题主要探讨亚胺培南诱导后的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌(CRKP)的耐药机制中,Acr AB-Tol C外排泵系统所起的作用,并比较野生型与诱导型耐药菌株间Acr AB-Tol C外排泵系统表达量的
学位
目的:应用Logistic回归法和决策树分类法分析造影剂相关急性肾损伤(contrastassociated acute kidney injury,CA-AKI)的危险因素,建立CA-AKI预警模型,识别AKI高危患者,早期预测AKI发生。方法:选取2016年1月至2019年9月于中国科学院大学宁波华美医院血管外科择期行介入手术患者,共纳入对象2131例,根据2012改善全球肾脏病预后组织(ki
学位
目的:1、验证中性粒细胞胞外诱捕网(Neutrophil Extracellular Traps,NETs)在急性痛风炎症反应中的作用。2、探究NETs成分蛋白(中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)、髓过氧化物酶(MPO))与炎症因子(IL-1β)、CRP的相关性。3、探究NETs在预测痛风急性复发及判断预后中的作用。4、探究秋水仙碱在痛风的治疗上及预防复发上的作用。方法:1、采集27例痛风急性发作期患者
学位
目的:探讨经皮耳穴迷走神经电刺激治疗功能性消化不良的临床疗效及其潜在的作用机制。方法:本实验采用交叉设计方案,将FD患者随机分为组1、组2两组,组1先进行taVNS治疗,组2先进行sham-TEA治疗,治疗疗程均为2周。经过2周洗脱期后,组1再进行2周sham-TEA治疗,组2再进行2周taVNS治疗。在每个治疗前后均对患者进行评估,评估内容包括:功能性消化不良症状量表、医院焦虑抑郁量表、胃容受体
学位
背景和目的:脑梗塞是严重危害人类健康和生命的疾病。心房颤动促进血栓形成并导致脑梗塞的关系已被广泛认知,但越来越多的证据表明心房颤动背后的心房心肌病才是事件链中的核心因素。而除心房颤动以外的房性早搏、房性心动过速以及心房扩大亦可能是心房心肌病的表现。我们试图研究24小时动态心电图中的房性心律失常及心脏彩超中的左房大小是否与脑梗塞的发生相关。方法:我们回顾性地收集了2018年1月至2019年12月在宁
学位
目的:在动物模型及体外研究中已有报道NK细胞对活化T细胞具有杀伤作用,但是这种杀伤作用与异基因造血干细胞移植术预后的关系尚不明确。本研究通过CD107a脱颗粒实验采用一种检测供者NK细胞对活化T细胞杀伤活性的技术,探讨供者NK细胞对活化T细胞的杀伤活性与移植预后的关系,为选择最佳供者及预测移植物抗宿主病风险提供新的手段。方法:本研究纳入98例接受allo-HSCT的血液恶性疾病患者,利用流式细胞术
学位
虚拟现实影像中对于个体记忆的构建和呈现,以真实事件为内容核心,以第一人称叙事为视角,通过承载个体记忆的象征符号和交互设计为体验者创造情感体验。记忆宫殿作为连接个体记忆与VR影像的一种媒介,它以空间中的记忆桩为元素,通过把抽象的认知具象化,再进行记忆碎片的情节连接,以此达到建构个体记忆影像的目的。从VR对体验者的影响来看,记忆宫殿的构建提升了虚拟现实影像表达的叙事技巧,为体验者带来了层次丰富的体验,
期刊
目的探讨血清壳多糖酶3样蛋白1(chitinase-3-like protein 1,CHI3L1)在肝脏疾病不同阶段的表达水平特征,评估其区分慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)相关肝纤维化程度的能力,确定其对于肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的预后价值,并建立HCC预后模型。方法选择中国科学院大学宁波华美医院2018年12月至201
学位