【摘 要】
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目的:通过16S RNA高通量测序技术比较脑损伤早产儿及正常早产儿肠道菌群的特点及差异,进一步探讨肠道菌群与早产儿脑损伤的潜在联系,为预防及治疗早产儿脑损伤提供新的思路。方法:纳入21例诊断脑损伤的早产儿为脑损伤组,对照组为按住院号随机抽取同期在我院住院的17例正常的早产儿,两组分别在出生后的第一天、第三天、第七天采集粪便样品,用高分子量测序平台对粪便样品的16S RNA V3-V4区进行扩增后采
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目的:通过16S RNA高通量测序技术比较脑损伤早产儿及正常早产儿肠道菌群的特点及差异,进一步探讨肠道菌群与早产儿脑损伤的潜在联系,为预防及治疗早产儿脑损伤提供新的思路。方法:纳入21例诊断脑损伤的早产儿为脑损伤组,对照组为按住院号随机抽取同期在我院住院的17例正常的早产儿,两组分别在出生后的第一天、第三天、第七天采集粪便样品,用高分子量测序平台对粪便样品的16S RNA V3-V4区进行扩增后采用高通量测序仪Miseq对其进行测序,通过数据处理及生物学分析,比较脑损伤组和对照组的肠道菌群的多样性和组成差异。结果:①共有114份早产儿粪便送检,其中33份粪便PCR扩增失败,均为早产儿生后第一天所得粪便样本,81份测序成功,共得1609个操作分类单元（Operational Taxonomic Units,OTUs）。②物种组成分析:在门水平上,出生后第三天及生后第七天脑损伤组和对照组主要以厚壁菌门、变形细菌门、放线菌门为优势菌门。在生后第三天,放线菌门在对照组中相对丰度显著增加（P＜0.05）,而厚壁菌门及变形细菌门在脑损伤组中相对丰度显著增加（P＜0.05）;生后第七天,放线菌门在对照组中相对丰度显著增加（P＜0.05）,而厚壁菌门、变形菌门在两组间的差异不具有统计学意义。在属水平上,生后第三天及生后第七天脑损伤组和对照组主要以肠球菌属为优势菌属。在生后第三天,肠球菌属在脑损伤组中相对丰度增加（P＜0.05）,双歧杆菌属、罗氏菌属在对照组中相对丰度增加（P＜0.05）;生后第七天,葡萄球菌属在脑损伤组相对丰度增加（P＜0.05）,双歧杆菌属在对照组相对丰度增加（P＜0.05）。差异菌群LEfSe分析:将脑损伤组及对照组生后1周内所有粪便样本进行分析后,发现脑损伤组以乳杆菌目为主要特征差异细菌菌类,对照组中以双歧杆菌属为主要特征差异细菌菌类。生后第三天,脑损伤组以肠球菌属为主要特征差异细菌菌类,对照组以罗氏菌属为主要特征差异细菌菌类;出生后第七天,两组间无明显差异物种。③物种多样性分析:Alpha多样性分析:第三天的Shannon指数:脑损伤组＜对照组（P＜0.05）、Simpson指数:脑损伤组＜对照组（P＜0.05）;第七天两组间的差异不具有统计学意义。结论:1.早产儿生后一周肠道菌群在门水平上的优势菌群是以厚壁菌门、变形细菌门、放线菌门为主,在属水平上的优势菌群是以肠球菌属为主。2.早产儿脑损伤可能与早期肠道菌群异常定植存在相关性,表现为肠道菌群多样性降低。发生脑损伤早产儿的肠道菌群组成在门水平上表现为放线菌门相对丰度降低,厚壁菌门及变形菌门相对丰度增加;在属水平上表现为双歧杆菌属、罗氏菌属相对丰度减少,而肠球菌属、葡萄球菌属相对丰度增加,且在生后第三天肠道菌群的变化较第七天明显。
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