NLRP3炎症小体和自噬相关基因在系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞中的表达及相关性研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xxcdejingcai
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目的:NOD样受体蛋白3(NOD-like receptor protein 3,NLRP3)炎症小体是固有免疫的重要组成成分,由NLRP3、凋亡相关斑点样蛋白(Apoptosisassociated speck-like protein containing CARD,ASC)和半胱氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)构成。NLRP3炎症小体的激活有助于促进白细胞介素(Interleukin,IL)-1β、IL-18等炎症因子的成熟释放,因此在多种自身免疫性疾病中发挥着重要作用。既往研究发现NLRP3炎症小体在SLE患者外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中表达下降,但原因尚未完全阐明。有报道称微小RNA(Micro RNA,miR)-93-5p可以通过下调硫氧还蛋白互作蛋白(Thioredoxin-interacting protein,TXNIP)的表达抑制NLRP3炎症小体的产生。此外,越来越多的研究表明,自噬反应与NLRP3炎症小体的激活之间存在相互作用,某些自噬相关基因的过表达也可以影响NLRP3炎症小体的功能。本研究通过检测NLRP3炎症小体相关基因(NLRP3、ASC和caspase-1)和miR-93-5p、TXNIP在SLE患者和健康体检者PBMC中的表达以及血浆中IL-1β和IL-18的含量,探究SLE中NLRP3炎症小体激活的潜在调节机制。同时,利用生物信息学的手段筛选出在SLE中差异表达的自噬相关基因并加以验证,探讨NLRP3炎症小体的激活和自噬功能异常在SLE中的联系。方法:第一部分:研究对象包括28例系统性红斑狼疮患者和28例健康体检者。收集患者的临床资料包括血清免疫球蛋白、补体、红细胞沉降率、C反应蛋白等生化指标以及疾病活动度。应用实时定量PCR技术检测PBMC中miR-93-5p、TXNIP、NLRP3、ASC和caspase-1的表达情况。应用Luminex多因子检测技术测定血浆中IL-1β和IL-18的含量。使用受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC)分析检验miR-93-5p对SLE的诊断价值。应用统计学方法分析各项指标在SLE患者和健康对照间的差异性,以及指标间的相关性。第二部分:研究对象包括20例系统性红斑狼疮患者(其中16例与第一部分重复)和20例健康体检者。从GEO数据库中下载SLE患者PBMC中m RNA表达谱数据集GSE50772,利用常用自噬数据库和R软件的“limma”包识别出在SLE中差异表达的自噬相关基因(Differentially expressed autophagy-related gene,DEATG)。运用基因本体论(Gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析对DE-ATG的生物学意义进行注释。利用PPI分析筛选出关键DE-ATG,并应用实时定量PCR技术对其进行验证。最后对关键DE-ATG和NLRP3相关基因的表达进行相关性分析。结果:第一部分:与健康对照组相比,SLE患者PBMC中NLRP3的m RNA表达下降,miR-93-5p的表达增加,其余目的基因的表达均无统计学差异。SLE组内TXNIP与ASC和caspase-1、ASC与caspase-1的m RNA表达存在显著相关性,但miR-93-5p与TXNIP、NLRP3、ASC和caspase-1的表达均不存在相关性。血浆中IL-1β和IL-18的含量在SLE组和健康对照组间无统计学差异。ROC曲线分析显示miR-93-5p诊断SLE的AUC(ROC曲线下面积)值为0.774,具有作为诊断标志物的价值。此外,SLE患者的PBMC中miR-93-5p的表达与血清C反应蛋白的水平呈正相关。与健康对照组相比,合并LN的SLE患者PBMC中miR-93-5p表达明显增加,而不合并LN的SLE患者则无统计学差异。第二部分:按照校正后P值≤0.05和差异倍数(Fold-change value)≥1.5的筛选标准,总共得到了39个DE-ATG。GO富集分析显示DE-ATG在分子功能上集中在对细胞自噬、细胞分解代谢和DNA结合转录因子活性等生物学过程的调节上,KEGG通路分析则富集到了脂质与动脉粥样硬化、耶尔森菌感染和自噬等多条通路。PPI分析筛选出5个关键DE-ATG,分别是IL-1B(IL-1β)、PPARG、MAPK3、PTEN和FOS。实时定量PCR的结果显示,在SLE患者的PBMC中IL-1β和MAPK3的表达下降,PPARG的表达增加。相关性分析显示,在SLE患者的PBMC中NLRP3与IL-1β,ASC与PPARG、PTEN和MAPK3的m RNA表达水平之间存在相关性。结论:本研究发现miR-93-5p具有作为SLE诊断标志物的潜力,并可能与SLE所造成的肾损伤有关,但与PBMC中的TXNIP/NLRP3炎症小体激活通路无关。SLE患者PBMC中NLRP3的m RNA表达相较于健康对照组下降,ASC、caspase-1的m RNA表达以及血浆中IL-1β和IL-18的含量在两组间不具有统计学差异,这一结果可能与自噬相关基因PPARG的表达增加和MAPK3的表达减少有关。
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