自然资源使用权出让协议对于促进自然资源有偿使用、自然资源交易市场的发展,激活自然资源领域社会主义市场经济活力无可争辩地起到至关重要的作用。从自然资源利用发展的进程来看,自然资源使用权出让协议是自然资源管理行政机关对行政方式的转变,也是对自然资源法领域新的探索。随着资源经济和绿色经济的发展,自然资源使用权出让协议的应用也愈发广泛。这种广泛的应用体现了自然资源使用权出让协议将成为自然资源有偿使用的一种普遍的形式,并在实践中扮演着越来越重要的角色。自然资源使用权出让协议以合同的形式呈现,内里以行政机关履行管理自然资源的职能为内容,这种特殊的组合形式让自然资源使用权出让协议展现出一种性质上混合的状态。2019年出台的《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》把矿业权等国有自然资源使用权出让协议纳入行政协议的范畴,并规定了救济途径和裁判方式,对于解决实践中的自然资源使用权出让协议纠纷具有一定的指导意义。虽然法律已经对矿业权出让协议明文规定为行政协议,但是自然资源使用权出让协议的应用并不是局限在矿业权这一个领域。在渔业权领域、国有土地使用权领域等其他自然资源使用权领域里,自然资源使用权出让协议已然崭露头角,并呈螺旋式上升态势。实践中关于自然资源使用权出让协议的纠纷不断涌现,但是对其救济仍然存在许多等待解决的问题。首先,协议范围含蓄模糊的规定对司法实践中纠纷解决带来了不少的麻烦,无法解决发展中的自然资源使用权出让协议的法律适用问题,继而在司法救济当事人权益保护方面遇到障碍。其次,对自然资源使用权出让协议审查规则的不明确使得法院在对案件进行审理时侧重点产生差异,对司法的权威性以及对当事人利益的保护都产生了不利影响。再次,在对当事人违约的司法救济上也存在不同程度的缺陷。针对这些问题,本文从自然资源使用权出让协议的概念入手,通过对国外行政协议的性质以及救济的借鉴,在我国已有法律规范基础上,对自然资源使用权出让协议的行政协议性质进行明晰;系统梳理自然资源使用权出让协议法律规范;完善相关立法;在诉讼过程中融贯行政领域与民事领域法律规范;扩充当事人纠纷救济途径,对推动自然资源使用权出让协议的安全高效发展,完善我国自然资源法律体系具有重要的现实意义。