科技创新是发展先进生产力，实现跨越式发展的不竭动力。企业作为市场经济和技术创新的主体，发展高新技术产业，转变经济发展方式，促进经济转型升级，建设创新型社会，都需要不断提高自身的自主创新能力。　　加大研究开发的投入，是提高企业科技创新能力的基础性环节，但是，高新技术企业研发投资具有高投入、高风险、投资回收周期长等特点，研发成果是一种公共物品，政府有必要采取不同的公共政策，鼓励企业研发投资。　　针对研发投入，我国出台了一系列的税收激励政策，但是，在实际操作中，由于现行的税收激励政策涉及税种多，对享受税收激励的研发主体、研发活动、研发投入范围规定各自为政，缺乏系统性，企业要享受不同的税收优惠，要疲于应付不同的流程和资料需求；现行税收激励政策，侧重于微观的激励，未能引导企业如何跳出单个企业的范围来配置研发资源、设置研发机构；营业税改征增值税后，研发投入的税收激励政策发生了怎样的变化，企业如何应对，目前缺乏系统的研究。　　本文拟以税法理论为基础，对我国最新的研发投入有关的税收激励政策进行梳理，从分析研发投入的税收激励政策在Y公司实际运用出发，采用定性分析与案例分析相结合的方法，分析Y公司在享受各种研发投入税收激励政策过程中遇到的问题，提出Y公司的应对之策，使Y公司获得相应的税收收益。　　本文正文部分共有五个章节，第二章简要介绍了研发投入税收激励政策的理论和内容及研究现状。第三章梳理了我国现行研发投入税收激励政策，包括流转税、个人所得税、企业所得税和关税等税收激励政策。第四章以Y公司为例，分析Y公司在享受研发投入税收激励政策过程中遇到的问题。第五章针对第四章的问题分析提出应对之策。第六章是跳出Y公司单个法人单位的范围，综合配置研发资源、设置研发机构，以更多享受研发投入的税收收益。