论文部分内容阅读
目的：探讨双相II型障碍患者冲动攻击行为的全基因组DNA甲基化修饰。 方法：对5例有冲动攻击行为的双相II型障碍患者及5例无冲动攻击行为的双相II型障碍患者的全血基因组DNA采用Illumina 公司的人类450K甲基化芯片技术进行甲基化水平的分析。用R软件对原始数据进行预处理并筛选出样本分组间的差异甲基化位点。最后采用GCBI在线分析软件对差异候选基因进行功能富集分析。 结果：(1)对攻击组与非攻击组样本进行甲基化位点筛选，QC Report 检测得到各项指标符合Illumina 的质量要求。(2)采用β值作为衡量甲基化程度的指标，攻击组与非攻击组所有样本的甲基化位点beta值密度曲线趋于一致，成呈“双峰曲线”分布。(3)采用Subset-quantile Within Array Normalisation (SWAN)算法进行芯片内的归一化处理， beta值密度曲线趋于一致、分组符合实验设计要求。(4)采用pooled t-test方法筛选组间的差异甲基化位点，攻击组与非攻击组样本比较甲基化水平有差别。(5)攻击组与非攻击组样本差异甲基化位点在染色体上的分布有差别。(6)按基因注释分类和CpG岛注释分类筛选攻击组与非攻击组样本间的差异甲基化区域，差异甲基化区域在11个注释区域内均有分布。(7)GO分析结果显示：差甲基化位点参与信号传递等功能。Pathway分析中，主要为I型糖尿病信号通路。 结论：本研究攻击组与非攻击组样本比较双相II型障碍患者冲动攻击行为的全基因组DNA甲基化水平及甲基化DNA在染色体上的分布均有差别。本研究样本攻击组与非攻击组比较，按基因注释分类和CpG岛注释分类的11个区域内均有差异甲基化区域的分布。本研究攻击组与非攻击组样本比较差异甲基化位点主要参与信号传递等生物功能和多巴胺能神经突触、趋化因子信号通路等信号传导通路。