河北省新诊断HIV感染者病毒亚型、耐药及分子流行特征研究

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目的河北省环抱首都北京,东与天津毗邻,东南衔接河南、山东,西与山西为邻,因此河北省从地理位置来讲具有举足轻重的地位。艾滋病是一种较难遏制的传播性疾病,该疾病在河北省发现较早且近些年来具有急增的趋势。河北省独特的地理位置及艾滋病传播方式的改变,很可能会造成京津冀地区的艾滋病交叉传播与流行,因此了解河北省新诊断HIV-1感染者的毒株流行特征、本底耐药发生情况以及个体间间可能的传播关系,对整个京津冀艾滋病疫情的防控具有重要的意义。本研究以2020年1月至2021年6月河北省新诊断的1176份HIV-1感染者血浆样本和流行病学信息为基础,分析河北省HIV-1新诊断感染者的基因型分布和流行概况;通过构建分子传播网络,揭示出HIV感染者之间的传播关系,锁定重点人群和大型传播簇,为控制疫情建言献策。此外,利用测序结果,摸清河北省耐药毒株发生和流行情况,为河北省艾滋病患者的治疗策略的制定提供一定的数据支撑。方法1 HIV-1感染者样本与背景信息的收集:依托石家庄市第五医院,通过调取河北省抗病毒治疗系统信息,收集河北省各地级市新报告的2020年1月至2021年6月的HIV-1患者血浆样本并进行流行病学资料统计;2分离HIV感染者血浆,进行核酸提取和PCR扩增获得pol区1.3kb基因片段,经Sanger测序后得到pol区1.3kb序列,根据序列信息分析以确定河北省HIV基因型分布情况,对于可能的独特重组毒株采用半分子方法扩增其近似全长基因,通过多种方法分析其近似全长基因的重组形式;3用Hy Phy中的TN93模型计算序列两两之间的基因距离,筛选后导入Cytoscape中构建出河北省HIV-1分子传播网络,分析传播网络特征以阐明河北省HIV-1总体流行情况,并锁定重点人群。将入网的序列构建最大似然树,将最大似然树导入Tnet软件中分析各亚型HIV-1在河北省各市之间的传播方向;4将测序结果上传耐药网站识别耐药位点,结合背景信息分析河北省HIV感染者的耐药发生情况,比较不同亚型、不同地区之间耐药率的差异。结果1收集到的1176份样本检测阳性率91.84%(1080/1176),最终966例测序成功,总体为阳性率82.15%(966/1176)。以获得序列的966例感染者为研究对象,人群均年龄38.27(±14.25)岁,其中以男性感染者为主(92.1%,890/966),已婚(48.6%,469/966),同性性传播(71.4%,690/966)为主,患者分布于河北省全境11个地级市;2河北省新诊断感染者主要流行亚型为CRF01_AE(438/966,45.34%)、CRF07_BC(362/966,37.47%)和B亚型(75/966,7.76%),主要流行的是重组毒株,许多独特重组毒株(Unique recombinant forms,URFs)已悄然开始流行;两例独特重组毒株的系统进化发育树表明他们均是由男同性恋人群的CRF01_AE和CRF07_BC重组而成的二代重组体;3分子传播网络分析发现,河北省新诊断HIV感染者三种亚型传播簇均以MSM人群为主,且在地理上有明显的聚集性。CRF01_AE和CRF07_BC亚型存在节点数大于10的大型传播簇;4新诊断感染者以石家庄为中心向四周辐射,石家庄市是河北省CRF01_AE的主要输出地,CRF07_BC亚型的传出地包括石家庄市、唐山市和沧州市。5河北省本底HIV-1的耐药率为9.01%(87/966),主要发生在蛋白酶区(29例,3.01%)和非核苷逆转录酶区(37例,3.83%)。结论1河北省新近诊断的HIV-1感染者疫传播方式已由早期的血液传播转变为性传播(99.3%),其中男男同性性传播为主要传播途径(71.4%)。2河北省HIV感染者流行亚型以重组毒株为主,CRF01_AE(45.34%)和CRF07_BC(37.47%)占了大部分,许多独特重组毒株已经形成并有流行的趋势。3分子传播网络中MSM人群占主要部分,网络中存在大型传播簇,传播簇有明显的地理聚集性,控制传出地的疫情对全省疫情进展有重要的意义。4耐药毒株高位流行,治疗前耐药突变比例高达9.01%且耐药毒株在人群中广泛传播。图14幅;表20个;参67篇。
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