胃癌是常见的癌症,其癌症发生率约占全球所有癌症的6%,也是癌症导致死亡的第三大原因。胃癌的发生往往是一个多因素和多步骤的发展过程。从正常细胞发展为胃癌细胞是一个复杂的过程,其间可能会发生细胞的多次转换过程,从而发生胃粘膜组织的不典型增生以及肠上皮化生这些病理变化,这些改变统称胃癌癌前病变,而识别发生胃癌癌前病变的病理现象是进行早期治疗的基础,也是预防发生早期胃癌的可行性筛查计划。然而,胃癌癌前病变和早期胃癌往往多无明显的临床特征。从基因表达谱的角度,研究癌前病变和早期胃癌组织中潜在的生物标志物和相关的生物学过程,将有助于分析胃癌的发生发展机制,为临床早期胃癌的筛查提供帮助。为此,本文主要开展了以下研究工作:（1）胃早癌发展过程中关键m RNAs的筛选研究。通过在线生物信息学基因数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）下载得到包含不同阶段胃部病变（胃炎、低级别、高级别内瘤变和早期胃癌）相关的全基因表达谱芯片GSE55695和GSE130823,对两张芯片数据进行批次效应验证、数据标准化和探针重注释等预处理后,整合成一个新的表达谱矩阵。对包含不同阶段胃部病变的表达谱数据矩阵差异分析、构建蛋白质相互作用和共表达网络来筛选关键基因。采用富集分析研究关键基因的生物功能。研究结果表明,从各个病变阶段样本中皆筛选了新的关键m RNAs。其中,低级别内瘤变样本的关键m RNAs的生物学功能主要与蛋白质的分泌调节、维生素和脂肪的消化吸收、胆固醇代谢、血小板活化以及p53信号通路等相关。高级别内瘤变和早期胃癌的关键m RNA富集结果相似,皆富集到IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体结合下的病毒蛋白相互作用、类风湿关节炎以及幽门螺旋杆菌感染中的上皮细胞信号传导等通路。本研究为理解胃癌的发生与发展机制提供了理论基础。（2）早期胃癌发展过程中关键lnc RNAs的筛选研究。首先通过对上述两张芯片平台的探针信息进行重注释,获得了对应的lnc RNA表达谱数据;然后做差异分析筛选各病变样本中的差异m RNAs和差异lnc RNAs;接着采用这些差异表达的m RNAs和lnc RNAs构建lnc RNA-m RNA共表达网络,最后根据共表达网络的特征,将重要节点处的lnc RNA筛选为关键lnc RNAs。研究结果表明,早期胃癌发展过程中关键lnc RNAs可能参与了钾离子跨膜转运、精氨酸和脯氨酸代谢以及胃酸分泌等生物过程中。筛选的关键lnc RNAs PRDM16-DT、HOXA11-AS和SEMA3B-AS1可能与早期胃癌的发生发展有着密切关系,值得进一步的实验研究。（3）胃癌生存分析。从在线数据库GEO中下载胃癌GSE62254芯片表达谱数据,基于临床信息统计用于生存分析的样本。然后筛选与早期胃癌共有的差异表达m RNAs。接着,使用单因素COX、LASSO算法和多因素COX回归分析共有差异表达m RNAs,确定与预后风险相关的差异表达m RNAs并用于构建预后风险模型。最后以所有胃癌患者风险得分中位数作为分组标准,将样本分为高风险组和低风险组,使用Kaplan-Meier生存曲线分析两组生存率是否具有显著差异。研究结果表明,ADGRG7、CT83和MMP12构建的胃癌预后风险模型具有良好的预后风险预测能力,将为胃癌治疗中的临床决策提供客观依据。