小鼠诺如病毒的分离鉴定及其VP1基因序列和遗传进化分析

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小鼠诺如病毒(Murine Norovirus,MNV)是近些年新发现的一种感染实验小鼠的病毒,该病毒在小鼠中流行范围广,感染率高,是目前已知小鼠病毒中最流行的一种病毒。MNV可以导致某些先天性免疫缺陷小鼠如RAG2-/-/STAT1-/-小鼠发生致死性感染,干扰实验研究进行。目前国内对该病毒的研究报道很少。2009年本实验室首次报道了广东省实验小鼠的MNV感染状况,本研究目的在于对广东省小鼠繁育设施继续进行MNV感染情况的监测,收集阳性感染样本进行病毒分离鉴定及常规病毒生物学特征研究,对病毒的核衣壳蛋白(VP1)基因测序和序列分析,绘制系统发生树,了解广东地区MNV的流行特点、生物学特性、分子遗传特征和进化来源。  本研究应用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术对广东省4个小鼠饲养设施MNV感染情况进行跟踪监测,并在此基础上采用RAW264.7细胞对经RT-PCR检测确定为阳性的样本进行病毒分离,通过细胞病变、RT-PCR、间接免疫荧光试验及电镜观察等方法对其进行鉴定,结果从80个样本中分离到了15株MNV病毒(设施A分离到8株病毒、设施B分离到1株病毒、设施C分离到1株病毒、设施D分离到5株病毒)。将其中一株分离株采用空斑试验进行克隆纯化后进行电镜观察和TCID50测定,可见明显的病毒颗粒,颗粒呈球形,无囊膜,直径约35nm。按Reed-Muench方法计算得出TCID50为105.25/0.1ml。  应用RT-PCR技术针对MNV分离株的VP1基因的1626个核苷酸片段进行PCR扩增,将扩增产物连接在pMD18-T载体后转化到大肠杆菌中进行克隆。通过氨苄青霉素平皿筛选,将鉴定为阳性的克隆菌进行核苷酸序列测定及序列分析。将这15株MNV分离株与从GenBank获得的19株MNV参考株进行序列比较分析,基于VP1基因的1626核苷酸片段构建系统发生进化树,一起进行分子流行病学研究。结果提示:广东地区15株MNV分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别在89.7-100%和94.8-100%之间,其中NFY-1和NFY-4毒株序列完全一致。15株MNV分离株与其他19株MNV参考毒株核苷酸和氨基酸同源性分别在87.5-92.9%和92.4-98.2%之间。进化树分析表明来自设施A和设施D的13株病毒之间的亲缘关系较近,形成一个亚群。来自设施B的ZD-1毒株和设施C的ZYY-163毒株与来自广东(K162)、日本(S7-P2、S7-PP3)、韩国(K4)和德国(Berlin/04/06/DE、Berlin/05/06/DE)形成一个亚群。系统进化分析表明广东地区的MNV分离株来源并不相同,来自设施A和设施D的13株MNV分离株是本地毒株,而来自设施B和设施C的MNV分离株可能由国外传播进来。
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