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兔作为经济动物和宠物与人类关系密切。有文献报道兔易感染人兽共患的隐孢子虫兔基因型,对人类的健康是一种潜在威胁。国内目前有关兔源隐孢子虫的分子资料极少,河南省到目前为止还未见完整的有关兔隐孢子虫病流行病学方面资料,因此为掌握河南省兔隐孢子虫病流行病学资料和兔源隐孢子虫种类和基因型,本研究对河南省部分地区兔隐孢子虫病进行了流行病学调查,并对检查到的隐孢子虫从形态学、动物感染试验、卵囊排出规律和核糖体小亚基(18SrRNA)基因、肌动蛋白(actin)基因和卵囊壁蛋白(COWP)基因扩增和生物信息学分析等方面进行了种类鉴定及其生物学特性研究,鉴定出河南省兔源隐孢子虫流行种类和基因型,确定河南兔源隐孢子虫分离株和其它种类隐孢子虫之间的分子种系进化关系,为防控人兽共患隐孢子虫病提供了理论依据。为了解河南省兔肠道寄生虫感染情况,应用反复水洗涤沉淀法、饱和蔗糖溶液漂浮法、改良抗酸染色法和卢戈氏碘液染色法等寄生虫学检测方法对在8个规模化兔场采集的共1081份粪样进行了寄生虫检查。共检出虫卵和卵囊5类,其中原虫3类(球虫、隐孢子虫、贾第虫)、线虫2类(类圆线虫和兔栓尾线虫)。本次调查中共发现732份粪便样品为寄生虫阳性,寄生虫总感染率为67.72%(732／1081)；8个兔场的不同种类寄生虫平均感染率分别为：隐孢子虫3.42%,球虫64.11%,贾第虫5.27%,兔栓尾线虫1.39%,类圆线虫8.97%。本次调查发现兔寄生虫混合感染现象比较严重,其中两种寄生虫混合感染现象较为普遍。为掌握河南省兔隐孢子虫流行病学资料,应用饱和蔗糖溶液漂浮法和改良抗酸染色法对分布在河南省5个地区的8个兔场共1081份兔粪样进行检查,并对兔隐孢子虫感染的风险因素进行评估。结果表明：查出阳性样品37份,隐孢子虫总阳性率为3.42%(37/1081)；1-3月龄兔和小于1月龄的未断奶兔的感染率最高,分别达10.93%和4.11%。从37份阳性样品中分离到的卵囊大小和形态结构基本一致,卵囊大小为4.426-5.163μm×3.934-4.672μm,平均为4.91μm×4.28μm,卵囊形状指数平均为1.15。根据隐孢子虫卵囊形态分析结果,将发现于兔的隐孢子虫卵囊初步鉴定为微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)或隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidium rabbit genotype),具体有待分子鉴定。同时发现兔隐孢子虫感染存在年龄差异。动物感染试验表明,兔隐孢子虫既可感染免疫抑制的30日龄肉兔,也可感染免疫正常的30日龄肉兔,只是隐孢子虫感染后的潜伏期不同,分别为2d和8d；感染后均出现2个排卵囊高峰期,但第一个高峰期不太明显；排卵囊持续期(显露期)也不同,分别为5d和8d。根据发表的隐孢子虫18SrRNA基因、actin基因和COWP基因序列建立PCR方法,在国内首次对兔源隐孢子虫分离株的18SrRNA、actin基因和COWP基因成功扩增并测序,测序后的序列用Blast在NCBI核酸序列数据库搜索同源序列,.然后利ClustalⅩ1.81、Phylip3.64和DNAstar4.0等生物学软件对序列进行比对、构建分子进化树以及同源性分析。根据在18SrRNA基因位点、actin基因位点和COWP基因位点种系进化关系分析,河南兔感染的隐孢子虫为隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidium rabbit genotype)。有关兔隐孢子虫的分子特性研究,国内外报道较少。本研究在国内外首次对隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidium rabbit genotype)的GP60基因进行PCR扩增,序列分析表明河南省兔源隐孢子虫分离株发现一个亚型家族,两个不同的亚型。