【摘 要】
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目的:黑色素瘤是一种高度侵袭性的皮肤恶性肿瘤,进展快,死亡率高,严重危害人类健康。约50%黑色素瘤患者发生BRAF基因突变,在发生BRAFV600E突变的情况下,黑色素瘤代谢模式会发生一系列变化,并与维持肿瘤发展和免疫逃逸的肿瘤微环境产生相互作用。本研究旨在初步探讨BRAFV600E突变的皮肤黑色素瘤（SKCM）肿瘤细胞代谢重编程与肿瘤微环境中免疫细胞表型变化的关系。方法:本研究采用了来自TCGA
【基金项目】
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国家自然科学基金（51872332）；
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目的:黑色素瘤是一种高度侵袭性的皮肤恶性肿瘤,进展快,死亡率高,严重危害人类健康。约50%黑色素瘤患者发生BRAF基因突变,在发生BRAFV600E突变的情况下,黑色素瘤代谢模式会发生一系列变化,并与维持肿瘤发展和免疫逃逸的肿瘤微环境产生相互作用。本研究旨在初步探讨BRAFV600E突变的皮肤黑色素瘤（SKCM）肿瘤细胞代谢重编程与肿瘤微环境中免疫细胞表型变化的关系。方法:本研究采用了来自TCGA的465例SKCM患者的临床转录和体细胞突变数据进行分析,首先获取患者BRAFV600E突变情况,应用差异分析、基因富集分析以及生存分析构建肿瘤突变相关基因的细胞代谢LASSO回归模型,以预测黑色素瘤患者预后,并通过诺模图、ROC曲线和决策曲线分析来评估模型的预测能力。随后,我们在A375细胞系中通过分别转染特异性抑制人黑色素瘤BRAFV600E突变基因的质粒以及neg质粒,最后分别采用RT-q PCR和Western blotting验证相关基因的表达情况。为探讨黑色素瘤中免疫细胞的组成和功能,本研究使用基因表达数据来估计恶性肿瘤组织中的间质细胞和免疫细胞组成,分别用ESTIMATE和CIBERSORT算法检测肿瘤纯度和估计每例黑色素瘤患者22种免疫细胞类型的比例。我们随后发现免疫细胞的组成与肿瘤代谢模型之间存在相关性。结果:BRAFV600E突变患者与BRAFWT患者相比有569个基因上调,595个基因下调,全部差异的富集分析显示BRAFV600E突变富集程度最高的5条通路中有2条通路与代谢有关,这2条通路分别为嘌呤代谢和甘油酯代谢。在KEGG全部41个代谢通路中共包含1285个基因,其中50个基因属于BRAFV600E突变相关基因。Kaplan–Meier曲线分析显示共11个基因是与患者预后相关的独立危险因素,其中PRODH基因表达较高的病例表现出明显较短的OS（P=0.011）,而患者的DDO基因表达高表达则预示其预后更好（P=0.006）。应用LASSO法对三个基因（PLA2G5、PLA2G7、TBXAS1）建立细胞代谢评分模型。我们根据肿瘤代谢模型重新分配每个患者的风险评分,并生成肿瘤代谢风险评分（TMRS）以显示其对患者预后的预测能力（HR=1.72,95%CI:1.28～2.30）。结合TMRS和临床特征构建诺模图,预测准确率为0.68。实时定量RT-PCR结果表明在BRAF sh组中BRAF表达量明显降低,PLA2G5、PLA2G7、TBXAS1 m RNA的表达水平较质粒neg组及对照组有增加。Western blot结果说明PLA2G5、PLA2G7的表达水平在BRAF sh组A375细胞系中高于对照组,TXBAS1表达水平在三组中无明显差异,与上述分析结果趋势基本相同,即BRAFV600E突变患者基因表达水平均低于BRAFWT患者。我们进一步对黑色素瘤患者免疫浸润情况和TMRS评分进行相关性分析,结果表明CD8+T细胞和M0巨噬细胞可能与TMRS相关,这被认为是BRAFV600E突变患者的免疫编辑所导致。结论本研究基于TCGA数据库中黑色素瘤患者的基因表达情况分析BRAFV600E突变与肿瘤代谢的关系并构建代谢评分模型,该模型可以预测患者预后,且该模型与TME中两种类型的肿瘤浸润性免疫细胞具有相关性,为识别免疫编辑肿瘤新陈代谢的分子机制提供了新的见解。
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目的:本研究的目的是通过检测正常妊娠与重度子痫前期子宫蜕膜巨噬细胞M1型与M2型分型转换及两组蜕膜巨噬细胞中mi R-99b-5p的表达量,同时进行巨噬细胞培养进一步验证巨噬细胞极化与mi R-99b-5p的相关性。方法:选取2020.01至2022.01在中国医科大学附属第一医院产科住院行剖宫产分娩患者为研究对象,根据纳入与排除标准选取正常妊娠妇女25例纳入对照组,选取符合重度子痫前期诊断的22
目的:脉络膜黑色素瘤是成人眼内发病率最高的恶性肿瘤,预后较差,现有治疗手段效果不佳。本研究旨在探究亚精胺合成酶（Spermidine synthase,SRM）在脉络膜黑色素瘤中的调控作用及其上游调控因子miR-423-5p通过抑制SRM转录后表达对脉络膜黑色素瘤细胞增殖的影响。这些研究结果可为脉络膜黑色素瘤的治疗提供新靶点。方法:1、探究SRM表达量与脉络膜黑色素瘤患者生存率间的关系通过数据库G
目的:肺癌是目前全球范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,近年来,随着检测技术的提高,越来越多的驱动基因已被证实在肺癌的发生发展中起着至关重要的作用,部分基因相应的靶向药也在陆续研发。本文旨在研究肺癌罕见突变基因STK11和PTEN与晚期肺腺癌患者临床病理特征的关系及对患者预后的影响。方法:本研究收集了187例2006年1月至2020年3月就诊于中国医科大学附属第一医院肿瘤内科的晚期肺腺癌患者。通过
目的:胃癌是一种恶性程度较高的消化道肿瘤,探究与胃癌进展相关的分子机制,发现更具诊断价值的分子标志物,提供临床治疗新靶点,是胃癌研究领域亟待攻克的难关。环状RNA（circular RNA,circ RNA）是一种共价闭合环型非编码RNA,区别于线性RNA,其不具有5’caps结构和3’poly（A）结构。近年来,研究人员发现circ RNA可以通过竞争性结合mi RNA、调节基因转录、翻译蛋白质
目的:虽然全球范围内的胃癌的发生率和死亡率在逐步下降,但胃癌仍然是全球范围内最为常见的消化系统的恶性肿瘤之一。近年来,新辅助放化疗、手术治疗、术后放化疗及靶向治疗等联合性治疗的方法,在逐渐提高胃癌生存率的同时,可在一定程度上降低胃癌复发、转移的风险。然而胃癌起病隐匿、早期检出率低,且进展迅速,导致其治疗时病期较晚,很大程度上限制其治疗方式的选择和最终治疗效果。因此寻求有效的诊断和治疗的关键因子及其
背景:胃癌（Gastric cancer,GC）是全球最常见的恶性肿瘤之一。多项研究表明,幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,HP）阴性胃癌（HP-GC）患者比HP阳性胃癌（HP+GC）的恶性程度更高,总生存期（Overall survival,OS）更短。虽然之前对GC或者HP+GC患者的预后生物标志物进行了广泛的研究,但针对HP-GC的相关研究较少。近年来,大量研究表明可变剪接
目的:本研究首先测试基于石墨烯复合材料的柔性应变传感器的基本性能,再探索石墨烯应变传感器监测肠鸣音的可行性,通过分析传感器监测到的肠鸣音波形得到关于传感器监测的肠鸣音的信息,再分析胃肠肿瘤术后患者的肠鸣音波形增加对术后肠道功能的了解,以期应用于临床实践。研究方法:本研究首先制备了基于石墨烯/聚氨酯复合结构的柔性应变传感器,通过进行AFM和SEM拍摄分析石墨烯纳米片、石墨烯薄膜以及石墨烯复合薄膜的表
目的:肺癌的发病率在我国恶性肿瘤中居首位,也是全球癌症相关死亡的主要原因,5年存活率仍不足10%。本研究的目的是通过ERBB信号通路,筛选出新的与肺腺癌患者预后相关的关键因子,并进一步研究其影响肺腺癌患者预后的相关机制,从而为肺腺癌患者的预后提供新的预测标志物。方法:我们从TCGA数据库中下载了肺腺癌患者的RNA表达数据,从KEGG数据库中下载了ERBB信号通路上与肺腺癌患者预后相关的基因。利用l
目的:结直肠癌（CRC）作为发病率位居世界第三位、病死率居于第二位的恶性肿瘤,每年的患病人数仍在不断增加,CRC已成为对人类生存健康造成严重威胁的恶性疾病。由于在疾病早期缺乏特异性的症状与体征,许多患者在被诊断时已处于肿瘤进展期,加之缺少有效的治疗手段,这使得CRC患者的总体预后水平始终不尽如人意,因此进一步寻找有效的临床诊疗指标,为结直肠癌的治疗提供新的分子靶点已成为CRC研究中迫切需要解决的问
目的:糖原代谢是肿瘤代谢的重要途径,肿瘤细胞既可以通过合成糖原,加速摄取葡萄糖,储备能量;又可以在环境恶化时,分解储积的糖原,为细胞活动提供能量和生物大分子来源。胞内糖原代谢的关键调控酶主要包括糖原合成酶（GS）、糖原合成激酶（GSK）、糖原磷酸化酶（GP）以及葡糖-6-磷酸酶（G-6-P）。其中,糖原磷酸化酶（GP）家族成员肝型（PYGL）和脑型（PYGB）的异常改变已被证实与肿瘤的增殖、侵袭、