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目的:Fahr病又称特发性基底节钙化(idiopathic basal ganglia calcificatio n,IBGC),是一种以基底节及大脑其他部位钙化为特征的神经系统遗传变性疾病。目前已发现五个致病基因SLC20A2,PDGFRB,PDGFB,XPR1ISG15。其中PDGFRB目前在全球仅发现4个突变位点,迄今为止,在中国人群中尚无PDGFRB突变的报道。本研究旨在通过广泛收集中国汉族人群中特发性基底节钙化的患者,进行致病基因的筛查,努力发现新的突变位点,丰富Fahr病致病基因的突变库,了解其在中国人群中的突变谱情况。
方法:研究对象为收集的146位患者,患者来自福建、浙江、江西、安徽、内蒙古、四川等地门诊和住院病人,包括12个家系及134个散发病例。所有入组患者均排除SLC20A2基因突变并进行系统的临床评估、完善生化及神经影像检查。同时收集本院的200例颅脑CT检查已排除特发性基底节钙化的对照组。所有参与研究者均抽取外周血样,提取血样中的DNA,通过PCR(聚合酶链反应)扩增PDGFRB的编码序列,对扩增的PCR产物进行Sanger测序。测序结果通过HomoloGene数据库进行不同物种之间同源序列的比对,对突变位点保守性进行分析。同时通过MutationTaster、Polymorphism Phenotyping(Poly Phen-2)及Sorting Intolerant From Tolerant(SIFT)等软件来预测已鉴定出的突变位点的致病性及对蛋白质功能的潜在影响,并通过dbSNP、千人基因组计划及ExAC等数据库比对来评估已鉴定的突变位点的致病性。
结果:分别在两个家系中检测出PDGFRB的两个新发杂合突变:c.3G>A,c.2209G>A。c.3G>A存于在2号外显子,c.2209G>A存在于16号外显子。在200名健康对照及散发病例中未发现相同突变位点。突变的形式为错义突变。c.3G>A(p.M1?)影响初始密码子,ATG转变为ATA,通过SIFT软件预测其为致病性的,且在EXAC数据库、千人基因组计划及dbSNP中不存在。c.2209G>A(p.D737N)导致了天冬氨酸转变为天酰胺酸,通过Mutation Taster及Polyphen-2分析提示为致病突变。这种错义突变在EXAC数据库中出现频率为0.000008。在千人基因组计划及dbSNP中不存在。通过多重比对,提示受影响的氨基酸位于高度保守区,提示其功能的重要性。
结论:我们在中国汉族人群的Fahr病患者中,发现了PDGFRB基因的两个新突变,c.3G>A和c.2209G>A,这进一步扩大了Fahr病患者中PDGFRB的突变谱。Fahr病患者中PDGFRB突变的流行率较低,表明PDGFRB不是F ahr病在中国人群中的常见致病基因。
方法:研究对象为收集的146位患者,患者来自福建、浙江、江西、安徽、内蒙古、四川等地门诊和住院病人,包括12个家系及134个散发病例。所有入组患者均排除SLC20A2基因突变并进行系统的临床评估、完善生化及神经影像检查。同时收集本院的200例颅脑CT检查已排除特发性基底节钙化的对照组。所有参与研究者均抽取外周血样,提取血样中的DNA,通过PCR(聚合酶链反应)扩增PDGFRB的编码序列,对扩增的PCR产物进行Sanger测序。测序结果通过HomoloGene数据库进行不同物种之间同源序列的比对,对突变位点保守性进行分析。同时通过MutationTaster、Polymorphism Phenotyping(Poly Phen-2)及Sorting Intolerant From Tolerant(SIFT)等软件来预测已鉴定出的突变位点的致病性及对蛋白质功能的潜在影响,并通过dbSNP、千人基因组计划及ExAC等数据库比对来评估已鉴定的突变位点的致病性。
结果:分别在两个家系中检测出PDGFRB的两个新发杂合突变:c.3G>A,c.2209G>A。c.3G>A存于在2号外显子,c.2209G>A存在于16号外显子。在200名健康对照及散发病例中未发现相同突变位点。突变的形式为错义突变。c.3G>A(p.M1?)影响初始密码子,ATG转变为ATA,通过SIFT软件预测其为致病性的,且在EXAC数据库、千人基因组计划及dbSNP中不存在。c.2209G>A(p.D737N)导致了天冬氨酸转变为天酰胺酸,通过Mutation Taster及Polyphen-2分析提示为致病突变。这种错义突变在EXAC数据库中出现频率为0.000008。在千人基因组计划及dbSNP中不存在。通过多重比对,提示受影响的氨基酸位于高度保守区,提示其功能的重要性。
结论:我们在中国汉族人群的Fahr病患者中,发现了PDGFRB基因的两个新突变,c.3G>A和c.2209G>A,这进一步扩大了Fahr病患者中PDGFRB的突变谱。Fahr病患者中PDGFRB突变的流行率较低,表明PDGFRB不是F ahr病在中国人群中的常见致病基因。