鸭 MyoD1、SCD1、DRD1 基因变异对肉质和血清生化指标的遗传效应研究

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本研究以樱桃谷鸭(104只)、三穗鸭(133只)和兴义鸭(110只)为材料,主要采用PCR-SSCP结合直接测序法研究MyoD1、DRD1和SCD1基因变异对血清生化指标和肉质性状的遗传效应,并对不同多态位点及多态座位间的不同基因型进行聚合效应分析,以期找出对血清生化指标和肉质性状有积极影响作用的分子遗传标记辅助选择位点,服务于鸭的早期选育和育种工作,为改善鸭肉质性状,提高鸭的生产性能提供理论依据,为下一步开展3个基因的作用机制,基因间聚合效应研究等奠定工作基础。本研究主要结果如下:1.鸭MyoD1基因多态对肉质和血清生化指标的遗传效应分析(1)设计5对引物对MyoD1基因的1-4全部外显子及部分5’调控区和内含子进行SNPs检测,在樱桃谷鸭和兴义鸭MyoD1基因g.95589-95863区域发现1个处于5’调控区的SNP位点g.95617C>G,均属中度多态座位,基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在三穗鸭MyoD1基因g.95589-95863区域检测到5个SNPs位点,其中g.95730G>A处于5’端调控区内;g.95740G>A、g.95744A>C处于第1外显子内,g.95770A>C和g.95826C>T处于第1内含子内,属高度多态座位,基因型分布偏离了Hardy-Weinberg平衡(P <0.05)。关联性分析结果显示,g.95589-95863区域多态座位对鸭的血清甘油三酯、肌内脂肪和熟肉剪切力有显著影响(P<0.05)。(2)在3个供试鸭群体MyoD1基因g.100111-100414区域内均发现2个处于第3内含子内的SNPs位点g.100363C>A和g.100369A>G,均属低度多态座位,基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联性分析结果显示,g.100111-100414区域多态座位对所测鸭的血清生化指标没有显著影响(P>0.05),对鸭的胸肌熟肉剪切力影响显著(P<0.05)。(3)在3个供试鸭群体MyoD1基因g.100956-101194区域均检测到2个处于第4外显子内的突变位点g.101007G>A和g.101058T>C,前者导致谷氨酸(E)变成赖氨酸(K),后者导致精氨酸(R)变成半光氨酸(C),均属中度多态座位,3个供试鸭群体基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),关联性分析结果显示,g.100956-101194区域多态座位对鸭的血清高密度脂蛋白和胸肌失水率有显著影响(P<0.05)。(4)鸭MyoD1基因g.95589-95863座位和g.100111-100414座位的聚合结果显示,聚合基因型间的血清生化指标差异均不显著(P>0.05),但对胸肌肌内脂肪、熟肉剪切力和甘油三酯影响显著。MyoD1基因g.95589-95863座位和g.100956-101194座位聚合对鸭的血清总蛋白、白蛋白、球蛋白及胸肌pH24、失水率、熟肉剪切力和肌内脂肪均有显著效应。MyoD1基因g.100111-100414区域多态座位和g.100956-101194区域多态座位聚合后对总蛋白、白蛋白、熟肉剪切力和肌内脂肪有显著影响(P<0.05)。2.鸭DRD1基因多态对肉质和血清生化指标的遗传效应分析(1)设计4对引物扩增鸭DRD1基因CDS区,共1139bP,在3个供试群体DRD1基因CDS区c.130-587区域均发现c.189T>C和c.507T>A突变,樱桃谷鸭群体属低度多态座位,基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);三穗鸭和兴义鸭群体属中度多态座位,基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05);关联性分析结果显示,此多态座位对鸭血清白蛋白、甘油三酯和肌胸pH24有显著影响(P<0.05)。(2)在樱桃谷鸭DRD1基因CDS区c.572-980区域内发现2个SNPs位点:c.765T>A和c.912G>A,属中度多态座位,在三穗鸭和兴义鸭群体内发现2个SNPs位点:c.681T>C和c.765T>A,均属中度多态座位,3个供试群体此座位的基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。关联性分析结果显示,c.572-980区域多态座位对鸭血清总蛋白、球蛋白、白蛋白、白蛋白/球蛋白比、低密度脂肪蛋白及肌胸pH24和熟肉剪切力均有显著的遗传效应(P<0.05)。(3)鸭DRD1基因编码区c.130-587和c.572-980座位聚合对血清总蛋白、白球比值、甘油三酯及胸肌肌内脂肪、失水率有显著影响(P<0.05)。3.鸭SCD1基因多态对肉质和血清生化指标的遗传效应分析设计10对引物扩增鸭SCD1基因1-6全部外显子、部分侧翼调控区和部分内含子,在3个供试鸭群体SCD1基因g.936400-936800区域均发现2个处于5’调控区的SNPs位点g.936517C>G和g.936552T>C,均属中度多态座位,樱桃谷鸭和兴义鸭群体基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),而三穗鸭群体基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),关联性分析显示,此多态座位对甘油三酯、pH24、失水率、熟肉率和肌内脂肪含量均有显著影响(P<0.05)。
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