【摘 要】
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散种(shattering)是指植物的种子成熟后,种子从植株上脱落的特性。在豆科、禾本科等植物中散种的调控机制已有深入研究,而在菊科植物中相关研究较少,散种调控机理还未知。为定
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散种(shattering)是指植物的种子成熟后,种子从植株上脱落的特性。在豆科、禾本科等植物中散种的调控机制已有深入研究,而在菊科植物中相关研究较少,散种调控机理还未知。为定位克隆生菜中控制散种性状的基因,实验室利用已有的栽培生菜W111(不散种)和野生生菜PI491245(散种)杂交后自交获得F2代散种分离群体,该表型分离比符合孟德尔分离定律(散种:不散≈3:1)。利用该群体定位调控散种性状的候选基因。根据实验室已有分离群体,将控制散种性状的目的基因定位在6号染色体9.280Mb~17.002Mb之间,约7.72Mb。利用RNA测序的240份莴苣材料进行关联分析,结合功能注释,预测LG6581050与LG6580947为控制生菜散种性状的候选基因,它们的功能分别是乙烯相关因子和多聚半乳糖醛酸酶的。分析候选基因的表达量,LG6581050在生菜花托和苞片的表达量高于其他组织,而LG6580947在生菜的不同组织中都有表达。对散种近等基因系材料的总苞和花托进行了乙烯和细胞壁成分进行分析,发现乙烯含量在不散种和散种材料中无明显差异,而纤维素和果胶在不散种材料中显著高于散种材料,推测细胞壁成分含量影响散种性状。构建候选基因LG6581050与LG6580947的Crispr-Cas9敲除载体,并种植了LG6580947杂合编辑的T1代转基因植株。构建了LG6581050的超量表达载体以及互补载体,正在观察LG6581050互补载体T0代植株表型。红色叶片的生菜含有丰富的花青素,花青素有重要的保健功能。实验室前期对M9(深红)×S1(浅红)F2代群体进行遗传分析,发现该群体叶片颜色存在一个控制叶片深红和浅红的位点,并将目的基因定位在1号染色体的73 Mb~213Mb之间。利用F2与F2:3群体进行精细定位,将控制红色深浅的基因定位于94 Mb~101 Mb区域内,约7 Mb。利用已有的RNA测序数据与重测序数据,对定位区段内的基因进行差异表达分析,SNP差异分析与功能注释分析,推测功能注释为MYB7的基因LG1843017为可能的候选基因,并负调控花青素的合成。分析基因LG1843017在亲本中的序列差异,在亲本M9的3’UTR区发生碱基突变,缺失4个T,推测可能是该突变影响了蛋白质的翻译效率,进而影响其功能。构建了基因LG1843017 Crispr-Cas9载体与超量表达载体对该候选基因进行检测,获得的T0代阳性苗表型都未发生变化,推测该基因可能不是调控生菜叶色深浅的基因,需继续筛选候选基因并进行验证。
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