科技是第一生产力,是经济发展的决定因素,我国高度重视科研创新。为加快打通科技和经济社会发展之间的通道,国家要求加快科技体制改革。随着全面深化科技体制改革,我国科技体制从计划经济体制向市场经济体制转变,科研事业单位逐步向企业化过渡。科研院所迫切需要转变观念、提高管理水平,以适应形式的变化。科研院所主要从事科学研究工作,承担各类科研项目。近几年,国家增加科研项目经费的投入,相应对其管控也更加严格,科研院所为顺利完成并争取更多科研项目,就要做到高效、合理地管理科研经费。而目前,大多数单位都是“重科研,轻管理”,科研经费管理水平还有待进一步提高。在内部体制改革和外部监管加严的双重压力下,转制科研院所需要全面深入的对科研经费管理展开研究,发现问题的本质、找到应对的方法,提高管理水平,以适应形式变化。本文选取转制科研院所为研究对象,以科研经费管理为内容,从业财融合的角度展开分析。首先,介绍了科研经费管理现状、业财融合现状、业财融合与科研经费管理融合情况,然后对“转制科研院所”、“科研经费”等概念进行阐述,梳理了转制后管理的难点及转制前后不同的成本核算要求,根据论文理论基础对基于业财融合的科研经费管理模式进行理论分析。其次,以WB公司为例,结合业财融合理念、项目管理与经费管理融合理念对科研经费管理展开研究,分析其现状以及存在的问题,如:未分类管理不同口径来源的项目;无法满足转制后管理需求;业财融合度较低;信息化程度较低;不重视项目绩效评价。最终都反映为科研经费使用效率较低,科研经费管理不到位,不利于公司整体管理。针对以上问题,本文提出了几点建议:公司可以通过业财一体化科研经费管理流程再造找出科研经费管理的风险以及关键点,重塑流程,做到主动作为,积极管理;构造科研项目业财一体化信息管理平台,做到资源共享、数据互通,提高科研经费管理的效率;搭建立足业务全生命周期的全面预算,将预算指标细化到具体业务之中,共同作用,相辅相成,业务指导预算的编制,预算监控执行的效率;完善科研项目经费绩效考核机制,激励相关人员,调动他们的积极性,同时作为项目的总结为后续其他项目提供宝贵经验。