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目的:癌症严重威胁人类的健康,给社会及家庭带来了极其沉重的负担。因此癌症的早期诊断、治疗及预后一直以来都是研究的重点。本研究应用生物信息学方法来寻找对肿瘤有价值的生物标志物及对SIRTs在胃癌中进行分析研究来探讨其作用。方法:1.通过泛癌分析方法来探讨CSMD2和SIRT1在肿瘤中的潜在价值,主要从表达、预后、免疫、表观遗传等方面进行分析。2.用生物信息学方法对Sirtuins（SIRTs）在胃癌中的表达、预后及潜在分子机制进行分析,并对癌症基因组图谱（The Cancer Genome Altas,TCGA）中有差异表达的基因在胃癌细胞系和正常胃黏膜上皮细胞以及胃癌组织和癌旁组织样本表达水平的实时荧光定量聚合酶链式反应（quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-q PCR）实验验证。结果:1.研究发现CSMD2在大多数肿瘤中上调并具有中到高的诊断效率,并且高表达与患者的不良预后密切相关。此外,在大多数癌症中也观察到CSMD2启动子的高甲基化和高水平的m6A甲基化调节因子。在胃癌（Stomach adenocarcinoma,STAD）和胃食管腺癌（stomach and esophageal carcinoma,STES）中,CSMD2表达与肿瘤突变负荷（Tumor mutational burden,TMB）、微卫星不稳定性（Microsatellite instability,MSI）呈负相关;在头颈部鳞状细胞癌（Head and Neck squamous cell carcinoma,HNSC）中,与TMB、MSI和肿瘤新抗原（tumor neoantigen burden,TNB）呈负相关;在多种肿瘤中观察到抗肿瘤免疫缺陷和免疫检查点的上调,因此CSMD2可能与免疫逃逸和免疫抑制有关。2.研究发现SIRT1 m RNA表达在多种肿瘤中存在差异,SIRT1蛋白在肿瘤中也存在表达差异。在肾透明细胞癌（Kidney renal clear cell carcinoma,KIRC）（P＜0.001）和卵巢癌（Ovarian cancer,OV）（P＜0.01）中,SIRT1表达与病理分期级别呈负相关。SIRT1高表达的肾透明细胞癌和脑肿瘤患者的预后较好。SIRT1磷酸化蛋白表达分析发现SIRT1（NP036370.2,S47）在乳腺癌（P=1.22×10-7）、结肠癌（P=4.02×10-9）、肺腺癌（P=5.92×10-14）和子宫内膜癌（P=6.68×10-4）中表达水平高,在卵巢癌（P=1.58×10-2）和肾透明细胞癌（P=3.45×10-11）中呈现较低的表达水平;SIRT1（NP036370.2,T719）在乳腺癌（P=4.56×10-4）中表达水平高,在子宫内膜癌（P=5.66×10-8）中低表达。研究发现在多种肿瘤中SIRT1与肿瘤相关成纤维细胞（Cancer-associated fibroblasts,CAFs）存在明显相关性,其中在睾丸癌（testicular germ cell tumors,TGCT）和脑肿瘤中呈负相关,也与多种免疫细胞浸润相关。抗肿瘤免疫分析发现与多种免疫相关分子存在相关性,包括免疫检查点分子、MHC分子和免疫激活剂等。在多形成性胶质细胞瘤（Glioblastoma multiforme,GBM）中,SIRT1表达与TMB和MSI呈正相关关系。综上,SIRT1可能在脑肿瘤和肾透明细胞癌发挥抗肿瘤作用,在泛癌中可能作为免疫标志物。基因本体论（Gene Ontology,GO）富集发现SIRT1可能与节律过程及转录有关;通路富集发现长寿调节通路、Fox O信号通路和胰岛素抵抗等信号通路也可能参与了多种肿瘤发生、发展的机制。3.由于SIRT1泛癌分析发现SIRT1在多种肿瘤中有意义,考虑到SIRTs是以烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（nicotinamide adenine dinucleotide,NAD）为活性中心,因此,我们对SIRTs在胃癌中的作用进行研究。SIRT1在胃癌细胞系和胃癌组织中低表达,SIRT1高表达的胃癌患者预后较好。SIRT1和拷贝数变异（Copy number variation,CNV）及甲基化之间显著相关,并且SIRT1在胃癌中与抗肿瘤免疫细胞呈显著正相关。SIRT1、SIRT3和SIRT5之间有较强的相关性,SIRT6和SIRT7之间强相关。SIRT5、SIRT6和SIRT7在胃癌中高表达,SIRT5高表达的胃癌患者预后较好,SIRT6和SIRT7高表达与预后差相关。SIRT3（AUC=0.733）、SIRT5（AUC=0.800）和SIRT6（AUC=0.767）有相对较好的诊断价值。SIRT6和SIRT7与Galectin-9显著正相关,并与TMB和MSI显著正相关,此外,SIRT7与大多数抗肿瘤免疫细胞呈负相关,与免疫逃逸相关细胞呈正相关。SIRT7也与甲基化强正相关。功能富集发现SIRTs可能参与病毒致癌、烟酸和烟酰胺代谢、甲状腺激素信号通路、癌症中的转录失调、长寿调节通路、酒精中毒、细胞衰老、Fox O信号通路、AMPK信号通路、细胞周期和Notch信号通路等。结论:1.CSMD2在泛癌中可作为有潜在意义的诊断、预后和免疫逃逸或免疫抑制相关标志物。2.SIRT1在泛癌中可能作为一个新的免疫标志物;SIRT1在不同肿瘤中可能充当癌基因或抑癌基因的角色不同。3.SIRT1可能是胃癌的一个有前景的预后、抗肿瘤免疫相关标志物,也可能在胃癌的治疗中发挥作用。SIRT7可能是胃癌的癌基因,也可视作为免疫抑制或免疫治疗相关的生物标志物。