最高人民法院2019年12月出台的行政协议司法解释带来了全新的行政协议诉讼调解制度。在对人民法院公布的调解书进行研究分析发现在行政协议诉讼调解制度的实际运行中,存在行政机关利用行政协议诉讼调解制度随意处分法定职权,损害国家利益、社会公共利益和第三人合法权益的问题。对行政机关在行政诉讼调解制度中可能用以处分法定职权的途径加以规制,能有效防止行政机关随意处分法定职权,从而更好的保护国家利益、社会公共利益和第三人合法权益。行政机关在行政协议诉讼中处分法定职权的可能路径主要有三点,一是在立案阶段,将本属于行政诉讼受案范围的行政协议争议通过民事途径解决,利用民事诉讼调解中人民法院对行政机关处分法定职权的审查较宽松,从而避开人民法院的司法审查;二是在行政协议争议进入调解程序时,将本不能适用调解的行政协议纳入调解的范围,导致行政机关将不能处分的法定职权通过调解方式处分;三是在调解过程中,人民法院未审查行政机关与相对人达成的调解协议导致行政机关随意处分法定职权。针对以上三点可能的职权处分路径,本文认为可以采取以下措施防止行政机关利用行政协议诉讼调解制度随意处分法定职权。首先,在立案阶段采取保证行政庭法官对行政协议的审查权、不适用诉前调解以及不适用立案调解等措施,从而防止行政协议纠纷在立案阶段被认定为普通民事纠纷通过民事争议解决途径得到解决,防止行政机关在民事途径中不受限制的处分法定职权。其次,在立案后行政协议争议进入调解程序时,通过明确调解的适用范围来防止行政机关处分法定职权。通过明确不适用调解的行政协议类型,防止不能通过调解处分的权力在调解中被处分。最后,在调解中应当采取明晰行政协议中行政机关的法定职权、对双方达成的调解协议进行审查以及调解协议依法公开等措施,防止行政机关在双方达成的调解协议中随意处分法定职权。