【摘 要】
：
研究背景胶质瘤是中枢神经系统中最致命的肿瘤之一。以往的研究逐渐揭示了肿瘤微环境与胶质瘤患者预后之间的关联。然而,肿瘤浸润性免疫细胞与基质特征之间的相关性尚不清楚。研究方法在我们的研究中,我们首先从CGGA和TCGA获得了胶质瘤样本。通过CIBERSORT计算胶质瘤中肿瘤浸润免疫细胞亚型的景观。然后通过GSEA进行高/低巨噬细胞浸润组的功能富集分析。接下来我们构建了 PPI网络并分析了 102个核心
【基金项目】
：
国家自然科学基金（81772651和82072762）；
论文部分内容阅读
研究背景胶质瘤是中枢神经系统中最致命的肿瘤之一。以往的研究逐渐揭示了肿瘤微环境与胶质瘤患者预后之间的关联。然而,肿瘤浸润性免疫细胞与基质特征之间的相关性尚不清楚。研究方法在我们的研究中,我们首先从CGGA和TCGA获得了胶质瘤样本。通过CIBERSORT计算胶质瘤中肿瘤浸润免疫细胞亚型的景观。然后通过GSEA进行高/低巨噬细胞浸润组的功能富集分析。接下来我们构建了 PPI网络并分析了 102个核心基因的预后价值。其次,我们通过免疫相关性lncRNA也构建了预测模型。我们提取了 253个与预后相关的免疫相关lncRNA。经过LASSO分析和多变量Cox回归分析,8个免疫相关lncRNA用于构建分类器。通过WCGNA计算转录因子与免疫相关lncRNA之间的相关性。最终,我们在8个lncRNA和转录因子之间建立了一个网络。通过CIBERTSORT研究了核心免疫相关lncRNA在胶质瘤免疫微环境中的功能。研究结果我们发现巨噬细胞的高浸润与不良预后相关（P＜0.05）。在高巨噬细胞浸润组中检测到3个基因组,包括102个关于血管生成的核心基因。我们发现5个基质特征表明预后不良,包括HSPG2、FOXF1、KDR、COL3A1、SRPX2（P＜0.05）。采用5个基质特征构建的预后分类器显示出强大的预测能力（AUC=0.748）。我们在TCGA中验证了这个分类器,结果与CGGA一致。而基于8个免疫相关lncRNA分类器的有效性也在CGGA（AUC=0.869）和TCGA（AUC=0.902）队列中得到证实。研究结论本研究为胶质瘤开发了两种免疫相关预测模型,这些结果可能会激发胶质瘤患者免疫治疗的新策略。
其他文献
研究背景:皮肤鳞状细胞癌（CSCC）是世界范围内常见的癌症,其发病率正在上升。手术切除是治疗鳞状细胞癌的常用方法。然而,特殊部位、疤痕、高龄患者无法耐受手术或者难以界定扩大切除范围是手术疗法的一些弊端。在过去的几十年里,光动力疗法（photodynamic therapy,PDT）作为一种非侵入性的治疗方法,在我国已经成为治疗部分非黑色素瘤皮肤癌的一种选择。5-氨基酮戊酸（aminolevulin
研究背景及目的心肌缺血再灌注损伤（ischemia/reperfusion injury,IRI）时,缺血区、交界区和远隔区的心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞及中性粒细胞等都可能起到不同的作用。饥饿状态下心肌细胞的自噬现象是“弱肉强食”,即健康的细胞吞噬不健康的细胞。细胞之间可通过旁分泌和外泌体（Exosome,EXO）等媒介进行对话,那么非缺血的心肌纤维细胞释放的外泌体会对缺血的心肌细胞产生什么影
研究背景胃癌在我国的发病率和死亡率均位居前列。曲妥珠单抗联合化疗作为HER2阳性胃癌患者的一线治疗已经得到多个指南的推荐。但是,HER2阳性胃癌患者的肿瘤异质性明显,其活性通常受到耐药性的限制。受遗传因素、环境因素、饮食因素等影响,胃癌表现出高度的组织学、转录组学、基因组学和表型异质性。随着肿瘤分子生物学的进步以及高通量测序的发展,胃癌的研究进入了分子水平和高分辨率的层面。普通转录组测序（bulk
研究背景心力衰竭（heart failure,HF）在过去几十年间已蔓延成为全球流行的慢性心脏疾病的严重表现或终末阶段,即便在指南指导的优化治疗下,HF的病死率居高不下。氧化三甲胺（trimethylamine N-oxide,TMAO）作为肠道微菌群代谢产物与多种心血管疾病息息相关。但目前TMAO联合NT-proBNP预测缺血性心力衰竭（ischemic heart failure,IHF）患者
[目的]评价植物对膨胀土边坡的防护作用，为膨胀土边坡防护植被的选取提供科学参考。[方法]在广西壮族自治区南宁市膨胀土地区草本植被中，选取8种常见植物并提取其整体根系特征及分层根系特征，统计分层根系特征的根长量、根表面积、根直径、根体积4个指标值。采用熵值法对所提取的4个根系特征指标进行赋权量化，并基于不同指标的权重综合比较评价植被根系护坡效果的优劣。[结果]植被的直径在0.25～0.55 mm,随
目的:总结发育性癫痫性脑病特征并归纳相关癫痫综合征的特点,分类总结相关基因的致病机制。描述性分析总结68例发育性癫痫性脑病儿童的临床特征及基因变异结果。对影响发育型癫痫性脑病疗效的因素进行统计分析,为发育性癫痫性脑病的后续研究提供资料。方法:收集2017年1月1日至2021年12月31日在我院诊治的68例发育性癫痫性脑病患儿临床资料,对患儿的临床表现特点及基因变异情况进行描述性分析,并至少随访6个
研究背景细胞焦亡（Pyroptosis）是细胞的可调节性死亡（Regulated Cell Death,RCD）方式,2018年细胞死亡命名委员会将其定义为一种依赖于Gasdermin家族蛋白形成细胞膜膜孔的可调控的细胞死亡方式,经常但不总因胱天蛋白酶（caspases）家族的蛋白活化而完成。而调节性细胞死亡是指由一个或者多个信号转导模块激活的细胞死亡,因此,细胞焦亡是可以通过基因或者药理学进行调
掌跖角化症（Palmoplantar keratodermas,PPKs）是一种以手掌和足跖皮肤增厚、角化过度为特征的一组慢性皮肤病。病因较为复杂,一般可分为先天性和后天性。金属是一种重要的致病因素,目前常见的金属相关疾病包括过敏性皮肤病、掌跖脓疱病和自身免疫性疾病等。临床观察发现金属可能是导致后天性PPKs的原因之一。后天性PPKs常常伴有金属植入物（Metal implantation,MI）
目的:肌动蛋白样6A（Actin like 6A,ACTL6A）是三磷酸腺苷（ATP）依赖性SWI/SNF样BRG1/BRM相关因子复合体的重要组成部分。ACTL6A的过表达能够促进上皮-间质转化（epithelial-mesenchymal transition,EMT）过程,并被证明ACTL6A可通过EMT促进肿瘤的发生和发展。既往研究表明ACTL6A与肝癌、结肠癌等肿瘤的发生发展有关。但目前