【摘 要】
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产毛性状是长毛兔最主要的经济性状,寻找与长毛兔产毛相关的SNP标记是改良产毛性状的基础工作。本研究以沂蒙长毛兔育种群为试验材料,选取KRT31、KRT27、KRT85、SFRP2、Wnt10A、PGR、IGF-1、IGFBP1、PROP1、FAIM、CDK2基因为候选基因,利用混池测序对其5’调控区进行多态性检测,共发现21个SNP位点,并利用MALDI-TOF技术对SNPs进行分型;测定了家兔的
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产毛性状是长毛兔最主要的经济性状,寻找与长毛兔产毛相关的SNP标记是改良产毛性状的基础工作。本研究以沂蒙长毛兔育种群为试验材料,选取KRT31、KRT27、KRT85、SFRP2、Wnt10A、PGR、IGF-1、IGFBP1、PROP1、FAIM、CDK2基因为候选基因,利用混池测序对其5’调控区进行多态性检测,共发现21个SNP位点,并利用MALDI-TOF技术对SNPs进行分型;测定了家兔的产毛量、粗毛率、绒毛长度、粗毛长度、绒毛纤维直径、粗毛纤维直径等产毛性状;利用SAS8.0统计软件将候选基因5’调控区SNP位点与产毛性状进行关联分析。主要研究结果如下:(1)本试验共发现3个位点对长毛兔产毛量影响显著,分别为FAIM基因的位点-515、PROP1基因的位点-1020、CDK2基因的位点-336;其中FAIM基因的位点-515对产毛量的作用方式表现为加性效应。(2)本试验共发现8个位点对长毛兔毛长度影响显著,其中SFRP2基因的位点-759、-1029、PGR基因的位点-1445、-1511、KRT31基因的位点-524、KRT27基因的位点-865对绒毛长度有显著影响(P<0.05);KRT85基因的位点-1010对粗毛长度有显著影响(P<0.05);SFRP2基因的位点-933对绒毛长度及粗毛长度均有显著影响(P<0.05);长毛兔群体在位点-524、-865上处于Hardy-Weinberg不平衡状态;SFRP2基因的位点-759与-1029、PGR基因的位点-1445与-1511、KRT31基因的位点-524对绒毛长度的作用方式均为加性效应,SFRP2基因的位点-933对绒毛长度的作用方式为加性效应,对粗毛长度的作用方式为显性效应,KRT85基因的位点-1010对粗毛长度的作用方式为加性效应。(3)本试验共发现5个位点对长毛兔毛纤维直径有显著影响,其中KRT85基因的位点-1010、FAIM基因的位点-515、IGF-1基因的位点-1299对绒毛纤维直径有显著影响(P<0.05);KRT31基因的位点-524、SFRP2基因的位点-933对粗毛纤维直径有显著影响(P<0.05);KRT85基因的位点-1010、FAIM基因的位点-515对绒毛直径的作用方式为均为加性效应,IGF-1基因的位点-1299对绒毛纤维直径的作用方式为加性效应和显性效应,KRT31基因的位点-524、SFRP2基因的位点-933对粗毛纤维直径的作用方式均为加性效应。(4)本试验共发现2个位点对长毛兔毛纤维直径变异系数影响显著,其中PROP1基因的位点-1020对绒毛纤维直径变异系数影响显著(P<0.05),KRT31基因的位点-524对粗毛纤维直径变异系数影响显著(P<0.05);其中KRT31基因的位点-524对粗毛纤维直径变异系数的作用方式为加性效应和显性效应。(5)对目标基因的SNP位点进行单倍型构建及关联产毛性状和效应分析发现:CDK2基因的3种单倍型在绒毛长度、绒毛纤维直径方面产生了显著差异(P<0.05);SFRP2基因的2种单倍型在绒毛长度、粗毛纤维直径变异系数方面差异显著(P<0.05);PGR基因的2种单倍型在产毛量、绒毛纤维直径方面差异显著(P<0.05),且单倍型AC和TT的互作对粗毛纤维直径和粗毛纤维直径变异系数影响显著(P<0.05)。综上所述,本试验共发现12个位点对长毛兔产毛性状影响显著,CDK2、SFRP2、PGR基因上的单倍型及单倍型互作对长毛兔产毛性状产生显著影响。结果表明,KRT85、KRT31、KRT27、SFRP2、PGR、IGF-1、FAIM、CDK2、PROP1基因可能是影响长毛兔产毛性状的主效基因,或与主效基因关联。本研究筛选出来的12个SNP位点有望开发为用于长毛兔产毛性状选育的分子标记。
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