一、m6A甲基化相关基因与肝癌免疫微环境的关系 二、GDF15参与食管鳞癌顺铂耐药的机制研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:whm9903
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目的:目前研究表明,m6A(N6-methyladenosine,m6A)修饰与多种癌症的发生发展有关,但在肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中,m6A相关调节基因对肿瘤免疫微环境的潜在影响仍了解较少。因此,本研究探讨了 m6A与HCC免疫特征的关系。方法:通过TCGA数据库下载HCC患者转录组和临床信息数据并进行一致性聚类分析,我们确定了两个差异的HCC亚群。之后,通过LASSO回归分析筛选出4个m6A相关基因,通过风险评分构建了一个预后模型,并通过GEO和ICGC数据集进行验证,并分析该预后模型与两组HCC的分子和免疫特征之间的相关性。结果:我们发现m6A甲基化调控基因在HCC和正常样本之间存在差异表达,并与免疫检查点表达水平有相关性。使用一致性聚类分析,我们将HCC样本分为两个具有差异临床特征的亚型。相比于Cluster 1,Cluster 2与HCC不良预后、较高的免疫检查点表达水平和免疫细胞浸润水平相关,且富集了免疫和致癌信号相关通路。此外,我们利用4个m6A相关基因构建了一个风险模型。不同风险评分的患者有不同的生存时间、免疫治疗生物标志物的表达水平、TP53突变率以及对化疗和靶向治疗的敏感性。同样,在验证组中显示了该风险模型与HCC生存时间有关。结论:我们基于m6A相关基因构建的风险评分有希望成为HCC预后的有效工具,且具有鉴定HCC免疫特征的能力。目的:食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者会对化疗产生耐药性,导致治疗效果差。我们实验室前期研究发现生长分化因子15(Growth differentiation factor 15,GDF15)在多种肿瘤的发生发展过程中起关键作用,并与ESCC患者的预后呈负相关。但GDF15是否参与了 ESCC顺铂耐药过程仍不清楚。因此,本研究进一步探讨了 GDF15与ESCC顺铂耐药的关系。方法:通过生物信息学分析和ESCC组织免疫组化分析,我们发现了 GDF15与化疗反应呈负相关,并通过体外和体内实验进一步验证。采用流式细胞术、转录组测序等方法分析了 GDF15参与ESCC顺铂耐药的机制。结果:对化疗耐药的ESCC患者有较高水平GDF15蛋白的表达。我们进一步由机制实验观察到 GDF15 通过 TGFBR2(Transforming growth factor beta receptor 2,TGFBR2)调控AKT的磷酸化,提高了 ESCC细胞对低剂量顺铂的耐受性,并通过体内研究进一步验证了抗GDF15抗体增强了顺铂的肿瘤抑制作用。此外,代谢组学研究表明,GDF15可以改变食管癌细胞代谢,增加尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UDP glucuronosyltransferase family 1 member A,UGT1A)的表达。AKT和TGFBR2抑制可逆转GDF15诱导的UGT1A家族基因的表达,提示TGFBR2-AKT通路依赖代谢通路参与了 ESCC细胞对顺铂的耐药。结论:GDF15通过调节AKT磷酸化和细胞代谢对ESCC细胞产生铂类耐药性。本研究提示高水平的GDF15表达导致ESCC顺铂耐药,顺铂治疗期间通过靶向抑制GDF15可能会获得有益的治疗结果。
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