DAPK调控DDX20蛋白酶体降解的机制研究

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研究背景:死亡相关蛋白激酶(DAPK)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与多种细胞过程,如细胞凋亡和自噬等。DAPK可能作为肿瘤抑制因子或促癌基因,这主要取决于肿瘤类型及其下游信号网络。传统研究认为,DAPK主要通过p53途径诱导细胞的凋亡并参与细胞的自噬过程等来实现抑癌作用,在癌细胞中往往呈低表达或表达缺失。在肝细胞癌中DAPK表达下调,但在肝癌中DAPK的功能作用却鲜有研究。研究方法:通过CCK-8和SRB增殖实验、划痕实验和细胞侵袭实验,来探究DAPK表达量以及DAPK的下游基因DDX20的表达量对肝癌细胞功能层面的影响。通过Co-IP实验验证了DDX20可被泛素化介导的蛋白酶体途径降解,发生泛素化标记。通过质谱实验筛选出了DDX20基因潜在的特异性E3连接酶,然后设计这些E3的si RNA,瞬转到细胞中使其相对应的E3敲弱,检测DDX20的表达量,确定介导DDX20发生泛素化蛋白降解的特异性E3连接酶。实验结果:当DAPK表达量上升时,PLC/PRF/5肝癌细胞的迁移和侵袭被抑制,但对增殖没有明显的影响。通过细胞功能学实验发现,DAPK可通过DDX20抑制PLC/PRF/5肝癌细胞的侵袭和迁移。DAPK对DDX20的m RNA表达无影响,DDX20调控发生在蛋白降解层面。DDX20被特异性E3连接酶识别,进而被E3引导发生泛素介导的蛋白酶体降解。通过质谱分析筛选出E3的候选蛋白有四种,分别为UBR5、UBE3A、RBBP6和UHRF1。实验发现在UBR5和UBE3A表达被敲弱时,DDX20的表达量有明显上升,且在DAPK激酶活性被抑制情况下,UBE3A和UBR5的低表达可弥补DAPK因激酶活性缺失导致的DDX20蛋白不稳定现象,DAPK可保护DDX20免受UBE3A和UBR5介导的泛素化介导的蛋白降解,从而提升DDX20蛋白稳定性。实验结论:DAPK通过DDX20抑制肝癌细胞的迁移和侵袭。DAPK通过调控UBR5和UBE3A介导的DDX20蛋白酶体降解来维持DDX20蛋白的稳定性。
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