2010年4月，我国财政部、证监会、审计署、银监会、保监会五部委联合制订了《企业内部控制配套指引》，其中《企业内部控制审计指引》明确要求上市公司进行内部控制审计，但对于内部控制审计收费却没有具体的标准。在此背景下，本文研究了内部控制审计收费的影响因素，以期为内部控制审计定价提供相关的理论依据。　　本文首先基于委托代理理论、市场供需理论和博弈理论研究了内部控制审计的影响因素，其次以2012与2013年深沪市主板市场连续两年单独披露内部控制审计费用的上市公司为研究样本进行实证研究，分别对样本进行了描述性统计、相关性分析、回归分析。研究发现公司规模、事务所声誉与上市公司内部控制审计收费显著正相关；上市公司进行整合审计以及公司性质是否为国有控股与上市公司内部控制审计收费显著负相关；而独立董事比例、董事会会议次数与内部控制审计费用负相关，但不显著，可能的原因是影响独立董事监督制衡作用的因素还有独立董事质量、董事会工作效率等因素；代表公司内部控制复杂程度的应收账款占总资产的比例与内部控制审计收费显著正相关，存货占总资产的比例与内部控制审计收费呈负相关关系，但不显著，可能的解释为不同行业中企业存货数量存在较大差异,事务所在制定内部控制审计收费标准时并没过多考虑存货占总资产的比重对业务复杂程度的影响；另外，本文出现了与实证假设中完全相反的结论，即代表公司失效风险的两个指标，上市公司是否披露重大或重要内部控制缺陷以及是否被出具否定意见内部控制审计报告与内部控制审计收费之间均呈负相关关系，出现这种结论可能的解释是同一家会计师事务所对上市公司进行了财务报表审计与内部控制审计，在上市公司的财务报表审计中，注册会计师已经考虑了重大或重要缺陷对审计程序的性质、时间安排和范围的影响，所以在进行内部控制审计时直接获取了上市公司存在重大或重要内部控制缺陷的审计证据，即会计师事务所没有增加审计程序及审计成本，所以其内部控制审计费用反而较低。在此研究的基础上提出上市公司应加强自身内部控制评价体系，政府部门应规范内部控制审计费用信息披露，会计师事务所应积极倡导整合审计。