【摘 要】
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本文参照近缘物种线粒体基因组序列,设计特异引物,利用PCR和Long-PCR方法测序得到圆舌浮蛙(Occidozyga martensii)线粒体基因组全序列,序列全长18, 321 bp。圆舌浮蛙mtDNA碱基
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本文参照近缘物种线粒体基因组序列,设计特异引物,利用PCR和Long-PCR方法测序得到圆舌浮蛙(Occidozyga martensii)线粒体基因组全序列,序列全长18, 321 bp。圆舌浮蛙mtDNA碱基组成和蛋白质编码基因的密码子使用都与其它脊椎动物相似,但其基因组结构出现了新的重排方式,圆舌浮蛙mtDNA基因组包含了23个tRNA基因(多了一个串联重复的tRNAMet基因);D-loop区附近的几个tRNA基因重排,形成“LTPF”基因簇(tRNALeu(CUN)-tRNAThr-tRNAPro-tRNAPhe),同时蛋白质编码基因ND5移位到控制区下游。此外,在圆舌浮蛙mtDNA中,tRNAAsn位于tRNATyr和CO I基因之间,而在其他两栖动物mtDNA中,该基因位于tRNAAla和tRNACys基因之间。tRNAAsn基因的移位是首次在脊椎动物中发现。根据基因重排机制的倍增-随机删除模型,圆舌浮蛙mtDNA中“WANCY”区基因簇(tRNATrp-tRNAAla- tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)的基因排列顺序至少经过了一次复制-删除过程。基于21种无尾目动物的13个蛋白质编码基因和2个rRNA基因合并序列分别构建了MP、ML、BI三种系统进化树,以期为探讨蛙类的分类系统地位提供更多的证据。结果显示,在MP树中蛙科构成一个单系类群,但在ML树和BI树中蛙科与树蛙科和曼蛙科形成并系群,且具有较高的置信度。另外,在三种系统进化树中,关于中国蛙科动物亚科划分的问题没有得到很好的解决,但是根据基因重排与系统发生的关系,本文研究结果支持对中国蛙科物种两个亚科的划分即蛙亚科和叉舌蛙亚科。最后,本文对无尾目动物线粒体基因重排与系统发生的关系进行了探讨。
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