论文部分内容阅读
目的
分析新疆兵团2011—2016年肠道病毒71型(EV71)的基因亲缘关系,为手足口病的预防控制提供病原学资料。
方法采用RT-PCR扩增标本中EV71的VP1编码区基因,进行核苷酸序列测序及序列分析。利用MEGA6.06与GenBank代表株进行核苷酸同源性分析并构建系统进化树。
结果兵团37株EV71流行株之间VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为87.3%~100.0%和93.1%~100.0%,均为C4a基因亚型,分别处于7个相对独立的小的进化分支,流行株与代表株相比共有28处氨基酸位点发生了变异,有9株在第283氨基酸位点发生了由S(丝氨酸)到T(苏氨酸)的变异,在293氨基酸位点发生了由A(丙氨酸)到S(丝氨酸)的变异。
结论兵团2011—2016年EV71流行株均为C4a基因亚型,与代表株相比VP1区有28处氨基酸位点发生了变异,有9株流行株在283和293氨基酸位点发生了共同变异。