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目的
鉴定1例Ia型先天性糖基化障碍病(congenital disorders of glycosylation type 1a，CDG-1a)患儿PMM2基因的致病性变异。
方法应用PCR技术扩增其PMM2基因的编码区及相关剪切位点序列，并对PCR产物进行直接测序。参考ESP及SNP数据库对结果进行比对。利用protein BLAST系统分析突变氨基酸的跨种属保守性；利用PubMed BLAST CD-search系统分析PMM2蛋白结构缺失所丧失的蛋白功能域；用PolyPhen-2、SIFT及Mutation Taster软件对新变异进行功能预测。用全外显子基因组测序法明确患儿有无存在其他可疑变异。
结果患儿携带PMM2基因c. 458_462delTAAGA(p. Ile153*)和c. 395T>C(p. Ile132Thr)复合杂合变异；患儿父亲携带c.458_462delTAAGA杂合变异，患儿母亲携带c.395T>C杂合变异。其中c. 458_462delTAAGA(p. Ile153*)为未报道过的新变异，经PubMed BLAST CD-search系统分析其编码的PMM2蛋白结构存在10个蛋白功能域的丧失，生物活性被严重破坏，预测为可能有害变异；c.395T>C(p.Ile132Thr)在SNP数据库有收录，经功能预测为可能有害变异。经全外显子基因组测序明确患儿除存在上述PMM2基因变异外不存在其他可疑变异。
结论PMM2基因c. 458_462delTAAGA(p.Ile153*)和c.395T>C(p.Ile132Thr)复合杂合变异可能为患儿的致病原因，基因变异检测结果可以为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。