肝肾损害型毒蘑菇所属类群DNA条形码研究

来源 :吉林农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Engineer7002
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引起急性肝损害和急性肾衰竭的毒蘑菇主要隶属于4个类群,分别是鹅膏属、丝膜菌属、盔孢伞属、环柄菇属。这两种中毒类型都具有一定的潜伏期,在发病后需要针对中毒症状以及中毒原因采取及时救治方法,但是受限于近缘种和相似种的存在,以及在中毒事件发生后往往难以采集到完整标本,需要从剩余物、煮熟的蘑菇、呕吐物或者胃提取物中提取样本用于鉴定,这些情况都加大了毒蘑菇有效鉴定的困难程度。因此需要寻找受样本形态限制小并且对于样本的鉴定具有准确、高效等特点的鉴定方法,目前DNA条形码技术是一个较为合适的解决途径。本研究以鹅膏属23个物种、60份材料,丝膜菌属28个物质中60份材料,盔孢伞属16个物种40份材料,环柄菇属16个物种、27份材料作为供试标本,选择ITS、IGS、nr LSU、mt SSU、RPB1、RPB2、EF1-α、β-tubulin作为候选基因,使用真核生物通用引物进行扩增、测序,筛选4个属的DNA条形码。将种内与种间遗传距离差异、序列获得难易程度(序列获得率),物种辨别能力等三个方面作为评价指标。结果表明在4个属中,ITS序列具有较高的通用性,种内与种间距离存在明显的Barcoding Gap,能够准确的对4个属内物种进行区别,EF1-α和β-tubulin序列仅在鹅膏属中具有较高的通用性,并且种内与种间距离存在明显的Barcoding Gap,因此建议将ITS、EF1-α和β-tubulin基因作为鹅膏属的理想DNA条形码,在应用过程中可以根据实际需要采用不同基因片段进行扩增,以达到最好效果;ITS基因适合作为丝膜菌属、盔孢伞属、环柄菇的理想DNA条形码。在此基础上本研究还分别开发出了4个属的微条形码序列并设计出引物,并对引物的通用性和适用性进行了验证和分析,结果表明:这些引物具有良好的通用性,且具有较强的适用性,对材料品质要求低,能够扩增由于蒸煮或消化等原因导致DNA发生降解的材料,具有一定的实际应用意义。同时,本研究开发出Cortinarius tubarius和帆孢盔孢伞两个物种的分子身份证序列并设计出相应的特异性引物,在鉴定时无需测序、使用琼脂糖凝胶电泳观察条带即可做到对物种的准确鉴定,为毒蘑菇物种分子鉴定方法提供了新的研究方向。
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