牡丹(Paeonia suffruticosa)是一种重要的观赏植物。花色是牡丹的重要观赏性状之一。目前对牡丹花色发育的分子基础还缺乏深入研究,这在一定程度上制约了其花色的种质创新。本研究以凤丹栽培群(Paeonia ostii’FengDan Group’)中不同花色深浅的个体为研究对象,利用高效液相色谱和实时荧光定量PCR的方法,测定不同花色的凤丹花瓣中花青苷的组成与含量,以及类黄酮合成相关基因的表达式样,为探讨凤丹不同花色深浅变异的分子基础提供依据。主要研究结果如下：1、通过国际照明委员会(CIE)指定的L*a*b*表色系统对四种不同颜色深浅的凤丹花色进行描述,发现随着花瓣颜色加深,L*和b*降低,a*与C*升高,凤丹花瓣L*a*b*C*四个测定值之间具有极显著的相关性。2、高效液相色谱分析表明凤丹花色深浅与花瓣中的花青苷含量间呈显著的正相关关系。从花青苷组分上看,白色花瓣中没有检测到花青苷；浅粉色花瓣中,只检测到花青素Pn3G5G;粉色和深粉色的花瓣中,花青苷以Pn3G5G为主,同时含有少量Cy3G5G.3、通过实时荧光定量PCR的方法对22个候选内参基因在牡丹不同发育阶段、不同组织和不同品种中的表达稳定性进行评估,筛选出适用于牡丹不同研究体系的内参基因。通过综合评价,发现DUF1639、MBF1A、PP2C和RPS9的表达稳定性优于传统内参基因。4、通过分析类黄酮合成途径相关基因在不同花色凤丹花瓣中的表达式样,发现CHS基因的表达水平在不同颜色的花瓣中无明显差异且均表现出较高的表达水平,CHI、F3H、F3’H、DFR、LDoX、MATE和MRP基因在三种粉色花瓣中的表达水平均高于在白色花瓣中的表达水平。其中,参与下游合成途径的基因(DFR和LDOX)以及参与花青苷转运的基因(MATE和MRP)的表达水平随花瓣颜色的加深而升高,与花青苷含量呈显著的正相关关系。本研究通过比较凤丹不同花色深浅变异中类黄酮合成相关基因的表达式样,初步揭示了在类黄酮合成通路中,下游催化过程可能比上游催化过程对凤丹花瓣中花青苷积累的贡献更大。该研究为揭示凤丹花色发育中的关键基因和分子机理提供了有用的信息。