中国西南地区药用植物上链格孢属真菌的系统发育关系

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链格孢属真菌包括腐生的、内生的和致病的物种,这些物种会对多种重要植物造成病害,包括谷物、观赏植物、油料作物、蔬菜、杂草和药用植物。其中一些物种会产生强力的与植物病害和哺乳动物疾病的发展有关的真菌毒素。由于链格孢属真菌对植物和人类具有显著的负面影响,快速准确地鉴定链格孢属真菌的种类将为真菌学家和植物病理学家带来极大的帮助。为了解我国西南地区链格孢属真菌的多样性,从四川、贵州、云南、广西等省采集了500份药用植物病害标本。通过形态学和系统发育学研究,对采集的物种进行了鉴定并研究其多样性。在2018-2020年间共获得了68个链格孢属真菌菌株。我们使用了七个基因片段进行系统发育分析,它们的扩增率和简约信息特征都比以前的研究高。对ITS片段的核苷酸序列分析揭示出61株从药用植物上分离的链格孢属真菌,其它基因片段的结果如下:LSU(59)、SSU(57)、GPD(60)、TEF1(59)、RPB2(53)和Alt-a-1(61)。经过形态学研究和SSU、LSU、GPD、Alt-a-1、RPB2和TEF1的多基因系统发育研究,鉴定出8个新种,3个已报道种,20个疑似新物种。新种为:A.paraalstroemeriae(GUCC21586.3)、A.paraarborescens(GUCC21600.1)、A.paratenuissima(GUCC21601.4)、A.paraburnsii(GUCC21519.11)、A.pseudoarborescens(GUCC21103.2)、A.pseudoagaisen(GUCC21126.4)、A.disarborescens(GUCC2179.5)和A.pseudoalstroemeriae(GUCC21593.6)。三个已报道种为:A.arborescens,A.limoniasperae,and A.burnsii。此外,GUCC21591.3、GUCC21302.4、GUCC21589.5、GUCC21837.2、GUCC21173.2、GUCC21847.1、GUCC21950.1a、GUCC21862.1、GUCC2179.1、GUCC21163.1、GUCC21174.4、GUCC21303.1a、GUCC21588.4、GUCC21930.3、GUCC21871.1a、GUCC21589.1、GUCC21956.2、GUCC21602.3、GUCC21GH.2和GUCC21TLG1被认定为疑似新种,并需要进一步确认。本研究详细分析了我国西南地区链格孢属真菌的多样性及其与寄主植物的关系。本研究的发现将为病害防控和资源利用提供重要的参考依据。
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