家牦牛(Poephagusgrunniens)和藏绵羊(Ovis aries)作为青藏高原的土著种，在长期的进化过程中适应于青藏高原高寒、低氧、强辐射的地理环境，并发展为青海省主要的优势畜种，对当地牧区的经济发展和草地的合理利用起着重要作用。青海家牦牛和藏绵羊养殖过程中，牧民多采取自留自繁和集约化养殖的畜牧方式，以及无计划地引进外来品种，影响了家牦牛和藏绵羊群体的可持续发展。为评估青海家牦牛和藏绵羊群体的遗传多样性及近交程度，避免家畜发生近交衰退，促进青海省生态畜牧业的可持续发展，本文选用27个牦牛微卫星位点和23个藏绵羊微卫星位点，以微卫星荧光标记方法对青海家牦牛和藏绵羊各四个地理群体的遗传多样性及近交程度进行科学分析。
　　主要研究结果有：(1)家牦牛27个微卫星位点均具有中度-高度多态性；藏绵羊23个微卫星位点中21个位点处于中度-高度多态性，仅2个位点为低度多态性。(2)家牦牛四个地理群体遗传多样性高，高原型藏绵羊四个地理群体的遗传多样性水平高；(3)家牦牛群体内遗传分化程度低，群体内及亚群体间存在近交现象；高原型藏绵羊群体内遗传分化不明显，群体内及亚群体间存在近交现象。(4)家牦牛群体的遗传变异主要由群体内变异导致，各群体UPGMA聚类显示其聚类关系未与地理分布保持一致，遗传结构最佳聚类簇K=3；高原型藏绵羊群体内的遗传变异主要由群体内变异导致，其UPGMA聚类结果符合地理分布特征，群体遗传结构最佳聚类簇K=5。