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以从江西、湖南、广西等国内省份及韩国收集的包括灯笼椒、长椒、圆锥椒和簇生椒在内的辣椒自交系和杂交组合为材料，在建立快速高效RAPD分析技术的基础上，进行辣椒资源的RAPD分析，以评价我国辣椒地方品种及杂交种的遗传多样性，为应用地方品种间的杂种优势提供依据，并为一年生辣椒内主要变种的分类提供分子证据。主要试验结果如下： 1．辣椒RAPD分析的技术体系：25μl反应体积中，含160μmol／LdNTP，0.2μmol／L随机引物，30～50ng模板DNA，1.5U Taq聚合酶。反应程序为：首先94℃预变性4min；94℃变性1min；37℃下退火1.5min，72℃下延伸1.5min，40个循环后，72℃下延伸7min，最后于4℃保存直至取出。 2．在22个供试材料中，14个RAPD引物共扩增出1258条带，多态条带比率(PPB)接近50％，表明供试辣椒材料之间的遗传基础较窄。 3．依据RAPD分析数据，对包括一年生辣椒(Capsicum annuum L．)主要变种在内的供试材料进行了聚类分析。在D=0.69时，所构建的树状聚类图将供试材料分为3类：第一类是灯笼椒，第二类是圆锥椒，第三类包括簇生椒(朝天椒)和长辣椒(牛角椒)；在D=0.75时，将供试材料分成4个类群，将簇生椒和长辣椒区分开来；在D=0.77时，则更进一步区分长椒的杂种一代和自交系。聚类分析结果说明：4个辣椒变种之间，簇生椒与长椒亲缘关系较近，与圆锥椒次之，与灯笼椒最远。