甘薯是重要的食品、饲料、工业原料和生物能源作物。甘薯原产于热带地区,抗寒性弱,低温是制约甘薯贮藏的重要因素,由于贮藏过程中的低温胁迫作用,总产量约有1/3利用率下降,因此研究低温对甘薯贮藏的影响意义重大。本研究首先对不同温度贮藏期甘薯形态和营养、生理变化进行探究,随后对低温和适温贮藏28天的甘薯构建了9个独立转录组和小RNA文库,利用转录组测序、小RNA测序和降解组测序,系统分析了甘薯贮藏过程中响应冷害胁miRNA,并利用qRT-PCR对miRNA及其靶基因进行表达分析。研究结果如下:贮藏28天时,低温贮藏条件下薯块内部变黑。相比于适温,低温条件下贮藏甘薯含水量下降和总蛋白含量上升幅度较小,而淀粉含量下降和糖类含量上升幅度较大。同时,低温条件下贮藏的甘薯其SOD、POD活性及MDA含量在贮藏28天时显著高于适温条件贮藏的甘薯,说明甘薯贮藏时间超过28天时发生冷害。通过小RNA测序共鉴定出属于56个miRNA家族的195个保守的miRNA和191个甘薯中全新的miRNA。通过转录组测序共组装出110,110条转录序列,通过降解组测序技术鉴定出428个转录本被184个miRNA靶向。重要的是,在低温条和适温条件下贮藏甘薯中,有11个miRNA的表达被鉴定出存在显著差异。为了验证测序结果,使用qRT-PCR对miRNA及其靶基因进行表达分析。本研究通过对部分营养及生理变化的探究,结合多组学分析,提供了一个甘薯冷害胁迫中miRNA参与调控的综合的分子证据,初步揭示了甘薯贮藏过程中遭受冷害胁迫时的miRNA介导的基因调控机制。