长期以来，我国高校是政府行政权力的附属物，政府对高校事务干涉过多、包办过多，致使高校深深陷入“行政化”的泥潭不能自拔。这种普遍存在的“行政化”现象根源于扭曲错位的政府-高校关系，从根本上来说，高校“行政化”是官僚科层制管理在高校管理中被滥用，如果无法重构政府-高校关系，高校“去行政化”问题就无从谈起，重构政府-高校关系已经成为“去行政化”无法回避的核心问题。　　通过梳理我国政府-高校关系的演变历程，对各个时期政府-高校关系特征、历史背景和深层次原因进行历史分析，指出当前政府-高校关系面临的困局。在此基础上，总结历次高等教育管理体制改革在政府-高校关系方面的实践探索，通过对南方科技大学的个案剖析，并借鉴民国时期（1912年-1949年）和美、英、日等国高等教育管理体制改革经验，并结合我国特殊国情和我国高等教育改革与发展的实际，指出重构政府-高校关系是我国深化高等教育管理体制改革的当务之急和现实课题。重点研究面对当前“去行政化”进程中政府-高校关系的基本矛盾困局，重构政府-高校关系应当从政治层面、政府层面、高校层面、社会层面四个方面同时努力，多管齐下:政治层面，应项层设计先行、党政权力分离;政府层面，应厘清政府职责、简政放权、政校协同共治;高校层面，应打破内部管理官僚制、推进管理民主化;社会层面，推动社会广泛参与，创新高等教育治理机制。研究如何让政府、高校、社会协同共治，通过管理理念更新和制度创新推进高校“去行政化”改革。