近年来随着实施积极的财政政策，扩大内需等政策措施，我国中央部门项目数量和金额急剧增长，行政事业单位的中央部门项目管理受到了广泛关注，尤其是项目预算管理，财政部门改变了之前“重决算、轻预算”的观念，在对部门预算近十年的改革中，将项目预算提到了很重要的位置。在逐步的探索过程中，一些问题得以改善或解决，但是也还有相当一些深层次问题无法收到相应的效果，并且在改革的过程中，新的更加复杂的问题也在不断产生。尽管这是一个复杂的问题，因为它涉及到既要保证行政事业单位中央部门项目的管理不出问题，又要朝着更加科学规范的管理模式迈进，这是科学规范管理需要迫切解决的问题。　　本研究以行政事业单位中央部门项目为例，尝试运用项目预算管理这种先进的管理理念，采用规范研究和实证研究相结合的方法，针对行政事业单位中央部门项目预算管理体制进行研究，以建立科学、合理、统一的行政事业单位中央部门项目预算管理制度，达到有效整合行政事业单位现有的各种资源，形成一套行政事业单位中央部门项目预算管理解决办法，从而提高行政事业单位中央部门项目预算管理水平。　　本研究引入项目管理有关理论，比较分析了项目预算管理的特点，通过列举行政事业单位中央部门项目预算管理中的一些问题，从项目管理机构设置、管理链牛鞭效应、政策制定、文化因素、经办人素质、认识程度、激励约束机制等几个方面的因素分别阐述并剖析了产生问题的原因，对改善行政事业单位中央部门项目预算管理方式、流程等进行了进一步的探讨，对行政事业单位中央部门项目预算管理提出了对策性建议。　　本研究结论如下:把当前先进的管理方法应用到中央部门项目预算管理中，可以进一步提高中央部门项目管理水平，为进一步完善中央部门项目预算管理体系提供理论依据。建立以项目库、项目执行、项目监督、项目验收、项目绩效考评为内容的科学的项目支出预算管理体系，强化了项目决策的科学化和民主化，推进了项目管理的制度化、规范化、实现了项目管理的公正和公开。摒弃项目预算管理中的问题，完善项目预算管理流程，可保证项目执行的最终结果。本研究的方法与模式为行政事业单位其它类似项目预算管理提供了一个参考案例。　　本研究的难点:一是应用规范研究的方法梳理中央部门项目的预算管理制度体系、管理组织结构以及存在的问题并提出对策;二是实证研究需要变革既往的管理模式;三是行政事业单位以及中央部门项目的中国特色，使得可借鉴的理论与实践方法较少。　　本研究的创新点主要表现在:运用规范研究方法和项目管理理论，在行政事业单位中央部门项目预算管理中做了一些探索，希望在实际工作中形成可操作的管理模式，提高项目预算管理的科学性和有效性。