自1978年中国改革开放以来，随着市场化进程的推进以及纵向权力结构的调整，地方政府之间的横向联系日益增多，其中一个比较突出的成果便是以长江三角洲、珠江三角洲及京津冀地区为代表的国内区域经济一体化格局的迅速形成。此类以经济协作为基本特征的区域间横向合作，一方面对于实现不同地区间的优势互补，提升整体竞争力有重要意义；另一方面却易导致重复建设、产业结构趋同、地区封锁、政策性壁垒以及跨地区性公共物品供给不足等问题。具体而言，作为我国区域经济重要引擎的长三角，在转型升级的过程中，虽在竞争、合作等理念上取得共识，但仍受地方政府行政边界的制约，各自为政、碎片化等不和谐现象相当突出，一体化的道路曲折且漫长。为何会出现碎片化趋势；如何在当前的发展格局中推进统一的区域行政协调机制改革，确立恰当的理论基础是目前长三角必须面对和认真思考的首要问题。创新区域行政协调机制，加强地方政府间的横向合作，调适地方政府管理行为与经济发展之间的关系，促进地区间的平衡发展，已成为公共行政学研究的一个新领域。它既涉及技术、管理、经营等问题，还关系到转型期长三角区域经济发展、内在作用机理的理论诠释问题。本文选取整体性治理作为创新区域行政协调机制的指导思想，试图利用整体性治理倡导的方式、方法解决长三角区域行政协调中的障碍，以期实现权力整合、资源整合以及协调多元利益主体的目标。本文共包括六个部分。第一章为导论，主要介绍研究背景、选题目的、研究思路、研究方法以及相关文献资料的研究现状。第二章则是在辨析相关概念的基础上，探讨整体性治理与区域行政协调机制之间的关系，研究分析两者的契合性，构建研究的理论基础。第三章分析长三角区域协调与合作的现状与困境，认为该地区一体化发展的土壤已具备，但总体进展缓慢，收效甚微，须加强统筹协调，完善行政协调机制。第四章总结了国外发达国家区域行政协调方面的经验、教训，为研究提供了有益的启示。第五章提出整体性治理视角下长三角区域行政协调机制创新的思路与政策建议。最后一章是对前文内容的一个总结和梳理。总之，本文在结合世界公共管理发展新趋势的基础上，按照我国行政体制改革的形势要求，重点论述当前长三角区域行政协调面临的各种问题及挑战，借鉴西方国家区域合作的有益经验，探讨创新长三角区域行政协调机制的可行性途径，以此解决长三角发展过程中的瓶颈问题，增强公共政策协调整合的能力。