水稻（Oryza sativa）是一种重要的粮食作物,养活了世界近半数的人口,但其产量受到干旱的严重影响。在中国农业种植结构调整优化,粮食种植面积不断减少的大环境下,改良水稻抗旱性以应对全球气候变暖导致的潜在干旱灾害,对于稳定干旱下水稻产量有着重要意义。本研究在本室已毕业的郭子龙博士收集的图像表型数据及全基因组关联分析（GWAS）分析结果的基础上构建近等基因系,同时结合群体重测序数据及RNA-seq数据对4个干旱胁迫实验重要图像性状进行精细分析,尝试鉴定可能影响表型的效应基因。本研究首先将包含空育131在内共636份水稻品种的重测序数据重新进行变异识别,以GWAS结果中的lead SNP基因型为主要依据,同时尽可能选用两种极端表型作为父母本来设计杂交组合。最终确定了以空育131、青四矮16B等品种作为轮回亲本的37个杂交组合,并筛选KASP、CAPS、In Del标记用以构建近等基因系,目前大多数杂交组合已到回交二代以上,为鉴定效应基因和尝试对其抗旱性进行遗传改良提供材料。同时,利用生物信息学方法对干旱胁迫实验重要图像性状进行精细分析。首先将GWAS结果中超过阈值的SNP对应的169个基因作为初步的候选基因。通过对本组产生的群体RNA-seq数据进行分析,从候选基因中确定了66个表达量在不同lead SNP分型下有极显著差异的基因。利用水稻群体的变异数据结合关联分析的方法,寻找可能与表型有关的大效应蛋白变异,最终关联到7个具有大效应In Del变异的基因及21个具有大效应SNP变异的基因。本研究通过以上方法寻找效应基因,为后续效应基因鉴定及功能研究奠定基础,同时为高世代近等基因系的构建确定目标区段。