随着国家财政对科研经费投入的不断增加,高校科研经费呈大幅增长趋势,成为学校重要资金来源之一。高校科研经费管理经历了从小到大、从粗放到精细的过程,实行统一管理、集中核算的管理模式。但从近年监督检查、社会公众反映情况来看,高校科研经费使用过程中存在的问题突显,部分高校科研经费监管方面存在一定的缺陷,导致科研经费使用出现违法违纪等行为。财政部、科技部、教育部等陆续发布了关于加强行政事业单位内部控制、高等学校财务制度、科研经费监督管理等相关文件,显然加强高校科研经费内部控制建设已成为当前热点话题。通过对本文的研究背景和研究意义展开阐述,文章引出了加强高校科研经费监管的迫切性和必要性。科研经费监管分为内部监管和外部监管两部分,本文主要研究对象是高校科研经费内部监管问题。本人通过分析高校科研经费申请、放款、转拨和结算等步骤为读者介绍了科研经费管理的全过程,结合调查分析归纳出现在高校科研经费监管的现状及漏洞。论文最重要的一部分是设定控制关键点并构建科研经费监管体系。由于我国科研经费监管部门职能发挥的不是很好,监管制度不够完善,故文章通过提出的具体问题有针对性的制定出监管体系,对高校科研项目过程中的科研经费流向、使用、结算等环节制定相应的关键控制点,同时提出一种有关键控制点的科研经费监管体系。又借助内部控制要素进行补充,形成相对完善的监管机制,从而减少整个过程中的风险,提高高校科研经费的使用效率。文章最后通过对G高校在科研经费管理模式的改进前后进行对比分析,得出了本文提出的对监管过程中的风险采用控制点法可以降低科研经费内部监管中的一些风险,对提高科研经费使用效率是有一定作用的。