北斗卫星导航系统是中国正在实施的自主发展、独立运行的全球卫星导航系统，其中以星间测量和星间通信为代表的星间链路技术，对提高导航卫星星座的生存能力十分重要，也是下一代全球卫星导航系统的发展方向之一。导航星间链路的物理层信号体制多采用扩频通信技术，可是导航星间链路的复杂环境，为扩频通信的关键技术之一捕获带来了一定挑战。本文旨在研究直接序列扩频体制下的长码捕获算法。首先，通过分析导航星间链路的环境特点与功能需求，提出一种采用长PN码的直接扩系统信号体制。其次，在研究直扩系统原理和长PN码特点基础上，重点研究伪码捕获算法的原理，为长码捕获技术研究提供基础。再次，对国内外关于长码的捕获算法做了分析与比较，重点关注关键问题如何降低长码捕获时间与资源消耗量。最后，在借鉴和吸收国内外在长PN码捕获技术的基础上，根据导航星间链路的弱信号、大动态、高数据速率和短时突发通信特点，提出一种新的长码直捕算法。该新算法是采用基于FFT的捕获方式,并优化和改进了相关方式、搜索方式、采样率转换、信号累加、码动态补偿及判决策略等模块。论文最后通过理论分析和仿真，验证了所提算法的有效性与正确性。