【摘 要】
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据2020全球癌症统计数据显示,乳腺癌（Breast Cancer,BRCA）现已占总体癌症发病的11.7%,成为了最常见的癌症,其发病和死亡均位于女性癌症首位。随着信息技术的不断发展,医疗数据的概念也逐渐得到了广泛的应用,通过将数据挖掘技术应用于乳腺癌领域,深刻挖掘乳腺癌的预后分子机制,寻找新型治疗靶标,对乳腺癌患者的预后和生存具有重大的现实意义。首先,本文基于基因表达数据构建乳腺癌预后模型。先
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据2020全球癌症统计数据显示,乳腺癌（Breast Cancer,BRCA）现已占总体癌症发病的11.7%,成为了最常见的癌症,其发病和死亡均位于女性癌症首位。随着信息技术的不断发展,医疗数据的概念也逐渐得到了广泛的应用,通过将数据挖掘技术应用于乳腺癌领域,深刻挖掘乳腺癌的预后分子机制,寻找新型治疗靶标,对乳腺癌患者的预后和生存具有重大的现实意义。首先,本文基于基因表达数据构建乳腺癌预后模型。先对BRCA患者的临床数据进行补缺和数字化,初步筛选差异表达基因,再通过使用逐步Cox风险比例回归和Lasso回归等方法,从训练集中筛选影响BRCA患者总生存率的关键因素,得到9个与生存密切相关的基因,使用测试集进行模型验证,结果表明,低风险组与高风险组具有显著差异,模型分类效果良好。其次,为了进一步寻找BRCA患者的新型预后靶标,本文引入可变剪接数据,并基于可变剪接事件构建了乳腺癌预后模型。从BRCA患者的基因表达数据提取剪接因子,并对相应的可变剪接事件进行补缺和过滤,再通过使用逐步Cox 比例回归和Lasso回归等方法筛选得到10个与生存显著相关的可变剪接事件,建立Cox模型对BRCA患者分类,结果表明,低风险组与高风险组具有显著差异,模型分类效果优秀,证实了可变剪接事件与乳腺癌预后的关联性和其潜在价值。预后模型筛选得到的影响BRCA生存的9个基因和10个可变剪接事件,又通过可变剪接事件与剪接因子的相关性检验,提取出调控若干剪接事件的40个剪接因子。其中,部分已被证实与BRCA患者预后息息相关,部分已被证实与其他癌症的预后联系密切,还有部分目前的相关研究较为匮乏,在乳腺癌发生发展中扮演的角色还有待研究和发掘,这为研究人员更深层次理解乳腺癌的预后特征和寻找新型预后靶标提供了理论支持和数据支撑,也为相关医学实验提供了重点靶标。
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