与柿单宁自然凝固相关的ALDH2基因家族克隆与表达分析

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中国原产完全甜柿(简称“中国甜柿”或C-PCNA)与日本原产完全甜柿(简称“日本甜柿”或J-PCNA)的自然脱涩机理明显不同,不仅存在单宁细胞的“稀释效应”,同时存在可溶性单宁的“凝固作用”,但长期以来未见中国甜柿果实脱涩与乙醛代谢关键酶基因ALDH2间直接相关的研究报道。本研究以‘罗田甜柿’(Diospyros kaki Thunb.‘Luotian Tianshi’)转录组数据库为基础,在分析其自然和人工脱涩过程中单宁含量变化的基础上,克隆和筛选与乙醛代谢直接有关的ALDH2基因家族并分析其表达模式及其与C-PCNA自然脱涩之间的关系,以期为阐述C-PCNA自然脱涩分子机理提供一定的科学依据。主要研究结果如下:1.中国甜柿中的可溶性单宁累积持续到果实发育中后期,在果实成熟前伴随着可溶性单宁转化为不溶性单宁的过程。说明中国甜柿自然脱涩可能与可溶性单宁的“自然凝固”有关。2.通过生物信息学技术对‘罗田甜柿’转录组数据库进行筛选和分析获得醛脱氢酶2(ALDH2)家族的2个成员,分别命名为ALDH2a和ALDH2b;通过染色体步移和快速扩增c DNA末端(RACE)技术从‘罗田甜柿’幼果中获得ALDH2a c DNA全长序列1563 bp、ALDH2b c DNA全长序列1936 bp,ALDH2a编码423个氨基酸残基,具有ALDH蛋白所特有的ALDH-SF superfamily保守结构域;ALDH2b编码540个氨基酸残基,该序列有ALDH蛋白所特有的ALDH-SF superfamily、ALDH_F2BC保守结构域和一个PLN02466复合保守结构域。3.Dk ALDH2a在‘罗田甜柿’(C-PCNA)不同组织器官中均有表达,但在种子中的表达量最高;Dk ALDH2a在‘磨盘柿’(non-PCNA)果实2.5 WAB(Weeks after full bloom,花后数周)至20 WAB其表达水平持续下降,但20-25 WAB其表达水平骤然升高;Dk ALDH2a在‘阳丰’(J-PCNA)中2.5 WAB的表达水平最高,随后逐渐下降,与其可溶性单宁含量变化趋势一致;在‘罗田甜柿’(C-PCNA)中,2.5-5 WAB Dk ALDH2a表达量下降,但在10 WAB的表达迅速上升,以后随果实成熟其表达量逐渐下降。4.Dk ALDH2b在‘罗田甜柿’(C-PCNA)不同组织器官中均有表达,但在果心中的表达量最高;Dk ALDH2b在‘阳丰’(J-PCNA)果实发育过程中均以较低的水平表达;在‘磨盘柿’(non-PCNA)中Dk ALDH2b随果实发育表达逐渐增强,其中以10-15 WAB的表达量增长较快;在‘罗田甜柿’(C-PCNA)2.5 WAB至10 WAB,Dk ALDH2b表达水平先高后低,此后随果实的成熟其表达量逐渐上升至最高水平。5.乙醇处理‘罗田甜柿’果实,均能在6 d内完成脱涩,其可溶性和不溶性单宁含量变化值的基本相等;此外,处理后可见‘罗田甜柿’果实可溶性单宁迅速下降、不溶性单宁迅速上升的趋势,且与Dk ALDH2a表达水平变化趋势一致。综上所述,C-PCNA自然脱涩可能与可溶性单宁的“自然凝固”有关,克隆得到的单宁凝固相关基因Dk ALDH2a和Dk ALDH2b基因的表达模式与单宁凝固相关,推测其在乙醛的代谢中起关键作用。
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