鱼类干扰素调节因子克隆及其相关基因表达规律研究

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干扰素调节因子(IRF)家族是一类参与调节干扰素(IFN)和干扰素刺激基因(ISGs)的转录因子,而且IRF家族成员在机体免疫反应中有重要作用,如细胞因子信号转导、病原体应答、细胞生长调节和造血细胞分化等反应过程。目前在哺乳类中已鉴定了10个IRF家族成员,而在鱼类中鉴定了11个IRF家族成员,比哺乳类多了IRF-11。但有关IRFs的研究主要集中在哺乳类。本实验选择黄鳝(Monopterus albus)作为研究对象,克隆得到黄鳝IRF1、IRF4和IRF10 cDNA全长以及IRF2、IRF5和IRF7 cDNA片段,并用Real-time PCR方法研究这六个基因在黄鳝不同组织的表达和诱导表达;由于在哺乳动物中IRF4在B细胞、T细胞和树突细胞的生长和分化的过程中扮演着重要的角色,它可以通过IRF5,MyD88, IL21,pGC1α和NOD2等基因调节免疫途径,为了进一步了解IRF4的表达规律,接着研究了IRF4及其相关基因在模式生物斑马鱼(Danio rerio)中的表达规律。主要研究结果如下:本研究已扩增得到黄鳝IRF1 cDNA全长1674 bp,包含885 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码294个氨基酸(amino acid,aa),其.5’、3’端非编码区(untranslated region, UTR)分别为141 bp和648 bp;黄鳝IRF4 cDNA全长1716 bp,包含1356bp的ORF,编码452 aa,其5’UTR、3’UTR分别为42 bp和318 bp;黄鳝IRF10 cDNA全长1724 bp,包含1512 bp的ORF,编码503 aa,其5’ UTR、3’ UTR分别为60 bp和152 bp;黄鳝IRF2 cDNA序列577 bp,编码192 aa;黄鳝mF5 cDNA序列888 bp,编码295aa;IRF7 cDNA序列1183 bp,编码378aa。其中黄鳝IRF1有6个色氨酸残基,IRF4有5个色氨酸,IRF10有5个色氨酸,另外在黄鳝IRF1,IRF4和IRF10序列中各发现1个ATTTA基序。Real-time PCR检测十个黄鳝组织(头肾、肠、血、肝脏、皮肤、脑、心脏、中肾、肌肉、脾脏)中黄鳝IRF1、2、4、5、7、10表达,组织分布研究结果表明,黄鳝IRF1主要表达于心脏和肠,黄鳝IRF2主要表达于皮肤和脾脏,黄鳝IRF5主要表达于脑,黄鳝IRF7主要表达于皮肤,黄鳝IRF4主要表达于肝脏,但表达量低,黄鳝ⅠRF10主要表达于肠和血。为了了解IRF1、2、4、5、7、10表达规律,本研究采用寄生虫、细菌和病毒类似物刺激黄鳝和黄鳝头肾细胞来检测这些基因的表达。结果显示经隐藏新棘虫感染后黄鳝IRFs在头肾表达量随着感染级数增加而降低,且均在感染2级寄生虫的肠中表达量高,另外,黄鳝IRF4表达量被诱导显著上调。本实验对黄鳝腹腔注射嗜水气单胞菌,检测各时间段免疫器官中IRFs的表达变化,结果显示IRF2 IRF5不能被嗜水气单胞菌诱导表达,IRF1在6 h的脾脏表达上调到46.9倍,IRF4在24h脾脏表达显著上调到87.1倍,在48 h肾脏呈上调表达。测定嗜水气单孢菌和po-ly I:C免疫黄鳝头肾细胞后各时间段IRF1、2、4、5、7、10的表达结果显示,仅IRF4在72 h表达显著上调,而IRF1、7和10在72 h呈负调节,IRF1和IRF10在1 h表达上调,随后表达又下调。而嗜水气单胞菌和poly I:C几乎不能影响IRF5表达水平,IRF10在poly I:C诱导72 h表达上调,IRF4能被poly I:C诱导显著上调,在诱导6 h、24 h和48 h后表达量分别为58倍、37.6倍和17.5倍。本研究采用Real-time PCR方法分析了斑马鱼IRF4a、IRF4b、MyD88、NOD2、 IL21、IRF5、PGC1α和Mx基因在胚胎发育时期和健康斑马鱼各组织的表达变化,并测定了LPS和poly I:C刺激斑马鱼ZF4细胞后基因的表达变化。本实验第一次在硬骨鱼类上进行IRF4及其相关基因的表达,旨在为进一步探索他们之间的调节关系提供指导。结果表明,IRF4b在各个组织(肾脏、脾脏、脑、肝脏、心脏、鳃、肌肉、肠)中的表达量显著高于IRF4a,其肾脏、脾脏和脑中表达量分别是IRF4a的4.77倍、2.92倍、5.59倍,另外,除IRF5较高表达于肌肉组织外,其他基因均显著表达于免疫组织。IRF4b, IL21, MyD88, IRF5 和 NOD2呈母源性表达,ⅠRF4a在胚胎发育72 h表达量最高,而Mx和pGCla孵化前可能参与胚胎先天防御系统。经LPS刺激后斑马鱼IRF4a仅在48 h被上调,IRF4b 4 h和24 h表达被诱导下调,而Mx, IL21, NOD2 和 pGC1α表达在其他时间段表达上调,LPS和poly I:C几乎不能影响IRF5表达水平。然而,poly I:C能上调Mx, IL21, NOD2 和 pGC1α的表达。相反,在检测的大多时间点poly I:C下调MyD88的表达。和哺乳动物IRF4一样,硬骨鱼IRF4a不能被poly I:C诱导表达,而IRF4b能被poly Ⅰ:C诱导。诱导表达模式和系统进化树结果暗示着哺乳动物IRF4可能来自于硬骨鱼的IRF4a。研究结果IRF4a和IRF4b体内和体外表达模式存在差异,这表明IRF4可能在免疫系统中扮演不同的角色。这些研究说明鱼类IRFs可能在抗病毒天然免疫中发挥重要作用,其在抗细菌和抗病毒应答中的机制需进一步研究。
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