核磁共振研究人源hMog1和Ran蛋白质复合物结构与功能

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maigansws
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Ran是Ras超家族的一个小GTP酶,在多个细胞生理过程中发挥重要的功能,例如,大分子的核质转运,有丝分裂中纺锤体的形成以及有丝分裂末期核膜的形成。Mog1(Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein,MOG)是一个近来发现的Ran结合蛋白,体外研究表明Mog1可以促进Ran释放其结合的GTP和GDP,但是并不清楚它的释放机理及其生物学意义。因而获得原子分辩率的复合物结构很有必要,尽管Ran的晶体结构多年前已被解析,但想要获得Mog1和Ran复合物的结构还是个很大的挑战,源于这两个蛋白质的动力学特征以及复合物有多处柔性区域,例如Ran的switch I,II区域与不同蛋白结合后往往会有变构效应,另外Mog1存在几处非常大的loop,而核磁共振(NMR)技术是研究蛋白质动力学和构象变化的有力手段。几年前我们实验室的胡琦博士和刘迎博士克隆表达纯化并用NMR方法成功解析了人的Mog1(hMog1)的溶液结构,为我们进一步探索47KD的Mog1和Ran复合物的结构和功能打下了良好基础。在此,我们综合运用了多种核磁方法来研究Mog1和Ran蛋白质复合物的结构。首先,化学位移扰动实验结果表明Mog1与Ran结合表现为明显的慢交换,许多单体峰的强度逐渐减弱至消失,同时伴随着在其它地方新峰的出现,因而无法一一追踪化学位移的变化,这意味着复合物状态下需要重新指认化学位移。这一尺寸下的蛋白常规三共振实验需要全氘代样品,涉及蛋白质的变复性,样品只能在270C下稳定,然而相应的核磁谱图质量很差,无法进行常规的序列指认。为了克服NMR研究蛋白质的分子量的限制,我们采用了甲基选择性标记的技术,通过分子内NOE网络和点突变的方法指认了复合物状态下Mog1和Ran的大部分ILV的甲基;利用13C edited NOESY-HMQC谱,比较间接维1H演化时15N-去耦和不去耦实验,确定界面上的甲基基团。同时借助甲基-甲基的分子间NOE,获得了更为精细的复合物界面结构信息。综合顺磁弛豫增强(PRE)和残留偶极耦合(RDC)数据得到了复合物的长程约束和两个蛋白的相对取向信息,最终借助Haddock软件搭建了复合物的结构模型,并通过分子动力学模拟优化了结构模型。从结构模型出发,我们找到了几个影响相互作用的关键残基,并通过定点突变方法结合胞外胞内实验证实了这几个关键残基确实影响了 Mog1和Ran相互作用。酶活实验证实了 hMog1在胞外是Ran的核苷释放因子,复合物的结构模型提出了一种可能的释放机制,为后面的功能研究指引了方向。功能方面的研究与刘恒合作进行(功能方面研究详见刘恒博士论文),结果表明,在正常细胞的有丝分裂期,Mog1维持了 RanGTP的浓度在一个恰当的水平,从而保证了有丝分裂的正常进行。
其他文献
随着机器人在操作作业时与人或者环境接触的机会越来越多,迫切的需要一种安全的机器人系统,可以广泛地应用于机器人与人或者环境进行交互的情况,能够保证工作人员的安全和减
反刍动物蛋白质营养的核心是氨基酸营养。由于瘤胃微生物的作用,直接添加到奶牛日粮中的氨基酸,会在瘤胃中部分或完全降解,最终到达小肠可被吸收利用的氨基酸量很少。赖氨酸和蛋
本实验室前期研究表明低剂量重离子辐射能够水稻种子能引起其发育到三叶期出现生长刺激效应,并且表现为株高的显著增加,电镜观察发现其叶片线粒体数量增多。线粒体作为植物体
桦褐孔菌Inonotus obliquus(Pers.-Fr.)Pilát或Fuscoporia obliqua为多孔菌科褐卧孔菌属的药用真菌,主要分布于北半球45°~50°的地区,在我国主要分布于黑龙江省、吉林
概述了大数据技术对数学建模课程的影响,分析了民族院校教育教学及少数民族学生现状,提出在大数据背景下数学建模教学的改革措施,即改进课程教学内容,优化课程教学方式,强化
建立了固相萃取-超高效液相色谱(UPLC)同时测定乳制品中苹果酸、酒石酸、乳酸、乙酸、柠檬酸、富马酸等6种有机酸的分析方法。样品用体积分数1%氨水溶液提取,调节至中性后经M
传统的服务功能链(Service Function Chain,SFC)部署复杂,并且和已有的网络拓扑耦合十分紧密,灵活性和扩展性较差。网络功能虚拟化(Network Function Virtualization,NFV)作
随着人类社会的飞速发展,尤其是在18世纪经历了工业革命之后,人类的生产方式和生活面貌都发生了翻天覆地的变化。从手工业时代跃入工业时代的人类社会出现了大量机械和机器,也出现了最早的一批白领。进入现代社会之后,白领人群的基数进一步扩大,其数量已经远远超过蓝领阶层。城市白领人群被视为衣着白净从事脑力劳动的高收入人群,其办公环境通常也都是整洁干净,以写字楼办公室为主,办公状态中坐姿所占比例最大,甚至成了一
本文测定了 4个科14种植物在常态和脉冲电场作用下释放负离子的浓度,研究了不同植物在脉冲电场作用下释放负离子的倍增效应;选择脉冲电场作用下释放负离子倍增效应显著的植物
俄罗斯构成主义的“现代性”被视为西方现代建筑运动的发端,其中蕴涵的动态性动摇了古典秩序的严整和等级分明,越来越多的建筑师开始重新诠释建筑本体,试图将空间秩序的多元构建导向更为广阔的领域。现代主义思想变革的先锋建筑师们进行了大量的“空间试验”,构建出其中纷繁复杂的动态演变特征。笔者试图赋予“层构”以新的语义来建立形式、空间和秩序之间关联性,以期穿越动态空间的重重迷雾,寻找暗藏在其空间和形式表象背后的