植物抗逆基因资源平台的构建与分析

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植物的生长和繁殖很大程度上受到了生物和非生物胁迫的影响。然而,为了在地球上生存和繁殖,植物已经形成了一系列精细的机制来响应周围环境的改变,这是建立在植物长期的进化和育种的基础上。研究人员已经发现在植物中存在大量的胁迫抗性基因,并且它们在植物应对恶劣环境的过程中起到了重要的作用。因此,对这些基因更深入的研究显得非常有必要。在此基础上,PSGDb (植物抗逆基因数据库)被建立起来,用于系统地整合并存储这些植物抗逆基因和它们的遗传关系,这可以帮助我们对抗逆基因以及它们的功能有全面的理解。根据数据库中已有的植物抗逆基因的种类,我们对这些植物抗逆性进行了初步的分类,方便研究人员检索数据。同时,本数据库平台实现了自动更新功能,可以方便地获取公共的生物数据库中最新上传的植物抗逆基因数据。此外,提供一些有用的分析工具来方便我们找到更多潜在的抗逆基因,如通过本地Blast搜索本地数据库中的同源核酸或蛋白质序列,使用GBrowse浏览抗逆基因的特征和其所在基因组的位置等。本数据库资源平台支持用户对其中数据的统计和分析功能,如可以根据物种和抗性信息来查看植物中的某些抗逆基因的分布情况。PSGDb使用的关系型数据库系统是MySQL数据库,搭建平台服务器使用了JavaWeb框架——Struts 2, Hibernate 3和Spring 3,客户端则使用了JSP和Ajax技术来提供友好的用户交互界面。
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