大黄鱼TNFR和IgH的克隆及免疫相关基因的表达分析

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大黄鱼(Larimichthys crocea)是中国重要经济海水养殖鱼类之一,为中国特有的地方性种类,人工养殖技术的成功使其成为目前网箱养殖量最大的鱼类,但是随着养殖量的增加和养殖环境的破坏,常常导致大面积疾病的爆发,其中副溶血弧菌( Vibrio parahaemolyticus)是养殖大黄鱼中最常见的病原菌之一,给大黄鱼的养殖业造成了巨大的损失。本研究从大黄鱼免疫基因入手,首先克隆获得肿瘤坏死因子受体( Tumor Necrosis Factor Receptor, TNFR)和免疫球蛋白重链(Immunoglobulin heavy chain, IgH)的cDNA全长。从实验室已构建的大黄鱼EST文库和前人的研究中筛选获得18个免疫相关基因:Toll样受体9( toll-like receptor, TLR9)、Toll样受体22( TLR22)、肿瘤坏死因子受体13B(TNFR13B)、RAC-GTP酶(RacGTPase, RAC)、白介素8(interleukin8, IL8)、白介素10(IL10)、干扰素调节因子1(interferon regulatory factor, IRF1)、主要组织相容性复合物II a(major histocompatibility complex II a, MHCII a)、微球蛋白β2(beta-2 microglobulin, B2-M)、CC趋化因子(CC Chemokine, CC)、似CC趋化因子114(CC Chemokine-like114, CCL114)、似CC趋化因子(CCL)、基质细胞衍生因子(stromal cell-derived factor1, SDF)、免疫球蛋白D(immunoglobulin D, IgD)、免疫球蛋白轻链(immunoglobulin light chain, IgL)、臂板蛋白4e(SEMA4e)、半胱天冬氨酸酶9(CASPASE9)和C1抑制因子(C1 inhibitor, C1-IN)。采用实时荧光定量PCR技术检测经副溶血弧菌注射后2 d、4 d、8 d和12 d时大黄鱼脾脏中上述基因的表达变化。主要的研究结果如下:  (1)TNFR的cDNA全长为2016 bp,编码449个氨基酸。预测蛋白质分子量为49.7 kDa,等电点为5.47。SingalP分析其5’端含有一段信号肽(1-25 aa)。功能域分析发现其含有死亡域(360-436 aa),TNFR/NGFR富含半胱氨酸区域(87-127 aa,129-168 aa),死亡受体域(33-276 aa)和跨膜区域(10-30 aa,199-219 aa)。荧光定量PCR结果显示TNFR基因在雌性的卵巢中表达量最高,并且脾脏中TNFR在副溶血弧菌注射2 d和4 d实验组表达量显著高于对照组。  (2)IgH的cDNA全长为1917 bp,编码585个氨基酸。预测蛋白质分子量为65.2 kDa,等电点为5.84。SingalP分析其5’端含有一段信号肽(1-20 aa)。IgH含有一个82 aa的可变区(V区,V36-V117)和三个恒定区(C区,C157-C229C257-C334C476-C552)。荧光定量 PCR结果显示大黄鱼脾脏和头肾中IgH表达量显著高于其它检测的各组织,弧菌感染4 d时IgH的表达量显著高于未感染组。  (3)TLR22、IL10、C1-IN、IgD和IgL在注射后的2 d实验组表达量显著高于对照组,IRF1和SDF在大黄鱼应激4 d和8 d时实验组表达量均显著高于对照组,应激8 d时MHCII a的表达量显著高于对照组, IL8和RAC是在应激12 d时显著高于对照组。SEMA4e在应激2 d、8 d和12 d实验组表达量均显著高于对照组。CCL和CCL114在应激12 d时表达量显著下调,而CASPASE9、B2-M、TNFR13B、TLR9和CC在感染后其实验组和对照组无显著差异。  以上结果表明,在大黄鱼先天免疫中,脾脏扮演着一个很重要的角色。免疫相关基因在病原菌识别、信号传导等过程中发挥了重要作用。
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