我国的排污收费制度经过了大约30年的发展,经历了多次改革与完善,既吸取了国外的先进经验,又本着我国经济社会发展的实际情况,采用科学的方法,制定了具有我国特色的排污收费制度和收费标准。本文通过对精制流行性乙型脑炎灭活疫苗(Vero细胞)建设项目和云南思茅南亚啤酒厂污水处理厂建设项目的环境影响经济评价分析研究,认为我国的排污收费制度虽然存在一定的优点,但是由于收费标准偏低和制度不完善,仍然达不到预定的目的。首先,与旧的收费制度相比,收费水平有所提高,收费因子由单因子收费向多因子收费转变,由超标收费向排污即收费转变等,并且采用了科学的方法制定了收费标准,基本上达到了收费水平高于边际处理费用的要求。再者,通过与发达国家的收费标准与制度对比分析,我国则很落后,表现在收费水平偏低,收费范围偏窄等。经过分析,本文认为,我国的排污收费制度应该开发更加科学有效的制定方法,改变原有制度的滞后性,研究开发具有科学的、与时俱进的制度;再者,提高收费标准和扩大收费范围,与国际收费接轨,这样可以避免我国在外贸上遇到所谓的绿色关税壁垒;最后,本研究认为,我国对污染范围广,对环境危害严重的一些物品制定合理的收费标准和制度,以刺激其生产和使用。