目的:调查我国西南地区父亲和/或母亲为乙肝表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBs Ag)阳性的HBs Ag阴性儿童乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)疫苗接种后乙型肝炎病毒隐匿性感染(Occult Hepatitis B Virus Infection,OBI)的发生率,进行基因变异分析并探讨OBI发生的相关因素,为免疫接种后儿童OBI的流行病学研究奠定基础。方法:采集由父亲和/或母亲为HBs Ag阳性的HBs Ag阴性且接受过乙肝疫苗免疫的儿童血清标本211份。血清学检测由商品化化学发光法(chemiluminescent microparticle immunoassay,CMIA)试剂盒完成。排除年龄小于8m或乙肝疫苗全程免疫接种记录不清的儿童,针对HBV基因组Surface区、Pre-S区、Core/pre-core区及X区利用巢式PCR(nested PCR)检测血清中的HBV DNA,扩增产物纯化后测序并进行基因变异分析,2个或者2个以上区阳性的样本为OBI阳性。进一步利用荧光定量PCR(Real-time PCR)进行HBV DNA定量,同时收集了患儿出生史、喂养史等临床资料,分析OBI在该人群中的感染流行及相关因素。结果:共有186名患儿最终纳入本研究。我国西南地区父亲和/或母亲HBs Ag阳性的HBs Ag阴性儿童乙肝疫苗免疫接种后OBI的发生率为4.3%(8/186)。在8名OBI的患儿中,6名患儿的父亲为HBV感染者,2名患儿的母亲为HBV感染者。通过标准株比对,基因进化树及NCBI分型工具分析发现8例患儿中2例为C基因型,其中1例血清型adrq-,另1例血清型未知。3例B基因型及3例B、C基因型共同感染均为血清型adw2。2例被发现存在抗原决定簇‘a’的逃逸突变且其中P77 HBV DNA水平与显性感染相当,因此被认为是“假OBI”。另发现出位于主要亲水区(major hydrophilic region,MHR)的多个突变。注射乙肝免疫球蛋白(hepatitis B immune globulin,HBIG)不会降低OBI的发生率。母乳喂养及顺产并非OBI的危险因素,母乳喂养可能促进保护性抗体的产生。OBI患儿血清谷丙转氨酶(alanine aminotransferase,ALT)及谷草转氨酶(aspartate transaminase,AST)水平未见明显异常。结论:OBI存在于父亲和/或母亲HBs Ag阳性的乙肝疫苗免疫接种后儿童中。HBV S区的突变可能是导致OBI产生的原因。父亲为HBV感染者的孩子存在OBI的情况在本研究中多有发现,应重视父亲为HBV感染者的情况。喂养方式及生产方式对OBI的发生率并无影响。总体而言乙肝疫苗免疫接种效果较好,但对免疫接种后儿童HBV感染以及OBI的筛查仍应给予足够的重视,特别是对父母为HBV感染者的儿童OBI的筛查。