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目的:研究CD133和MACC1在新辅助放化疗后直肠癌组织中的表达情况及其与临床预后的关系。方法：采用免疫组织化学法检测福建医科大学附属协和医院2007至2011年间166例直肠癌组织CD133和MACC1的表达，其中行新辅助放化疗（NeoadjuvantChemoradiotherapy, CRT）患者82例，未行新辅助放化疗（Non-Chemoradiotherapy,Non-CRT）患者84例，并分析新辅助放化疗后直肠癌组织中CD133和MACC1的表达与其临床病理因素及预后的关系。结果：（1）免疫组化结果显示，CD133在CRT组中的表达高于Non-CRT组（68.3%vs34.5%，P<0.05），而MACC1在CRT组的表达低于Non-CRT组（53.7%vs75.0%，P<0.05）。（2）在CRT组直肠癌组织中，CD133阳性表达与肿瘤ypT分期、RCRG分级及是否复发转移有关(P<0.05)，与患者的年龄、性别、肿瘤位置、CEA、CA199、ypT分期、ypN分期、ypTNM分期、病理分型及分化程度均无关(P>0.05)；MACC1的阳性表达与肿瘤ypT分期、ypN分期、ypTNM分期及是否复发转移有关(P<0.05)，与其他临床病理因素均无关(P>0.05)。（3）单因素分析显示，影响新辅助放化疗后直肠癌患者不良预后的危险因素有CD133阳性表达、MACC1阳性表达、ypT分期、ypN分期及ypTNM分期(P<0.05)。（4）多因素Cox回归分析显示，CD133阳性表达、ypT分期及ypN分期是影响新辅助放化疗后直肠癌患者不良预后的独立危险因素(P<0.05)。结论:新辅助放化疗后直肠癌患者，高表达CD133和/或MACC1者预后较差，直肠癌干细胞可能参与了肿瘤组织对放化疗的抵抗。CD133可作为新辅助放化疗后直肠癌患者预后评估的指标之一。