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清初对儒家的批判分为两个方面：从学术上，批判宋代以来的理学，提倡经验主义的朴学；从政治上，批判秦以降日益严酷的君主专制独裁，主张恢复周代的封建制度。这种批判是中国现代学术和思想发展的直接资源之一，但它西方近代鼓吹科学民主和自由的启蒙思想有本质区别。朴学的“科学性”与西方近代科学完全不同；而对专制君主的批判也未从根本上否定专制制度本身，当然也就不具备民主自由的现代思想内涵。